Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
KRTAP9-3Q9BYQ3 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC107419.1-202ENST00000608735 1081 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
KRTAP9-3Q9BYQ3 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
KRTAP9-3Q9BYQ3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
KRTAP9-3Q9BYQ3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
KRTAP9-3Q9BYQ3 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
KRTAP9-3Q9BYQ3 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
KRTAP9-3Q9BYQ3 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
KRTAP9-3Q9BYQ3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
KRTAP9-3Q9BYQ3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
KRTAP9-3Q9BYQ3 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
KRTAP9-3Q9BYQ3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
KRTAP9-3Q9BYQ3 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
KRTAP9-3Q9BYQ3 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC244517.3-201ENST00000616254 1235 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
KRTAP9-3Q9BYQ3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
KRTAP9-3Q9BYQ3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
KRTAP9-3Q9BYQ3 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
KRTAP9-3Q9BYQ3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
KRTAP9-3Q9BYQ3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
KRTAP9-3Q9BYQ3 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
KRTAP9-3Q9BYQ3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
KRTAP9-3Q9BYQ3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
KRTAP9-3Q9BYQ3 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
KRTAP9-3Q9BYQ3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
KRTAP9-3Q9BYQ3 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
KRTAP9-3Q9BYQ3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
KRTAP9-3Q9BYQ3 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
KRTAP9-3Q9BYQ3 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
KRTAP9-3Q9BYQ3 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
KRTAP9-3Q9BYQ3 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC10.48□□□□□ -0.73
KRTAP9-3Q9BYQ3 RN7SL275P-201ENST00000582762 335 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.48□□□□□ -0.73
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC092068.1-201ENST00000592525 454 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
KRTAP9-3Q9BYQ3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
KRTAP9-3Q9BYQ3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
KRTAP9-3Q9BYQ3 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
KRTAP9-3Q9BYQ3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
KRTAP9-3Q9BYQ3 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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KRTAP9-3Q9BYQ3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
KRTAP9-3Q9BYQ3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
KRTAP9-3Q9BYQ3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
KRTAP9-3Q9BYQ3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
KRTAP9-3Q9BYQ3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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KRTAP9-3Q9BYQ3 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
KRTAP9-3Q9BYQ3 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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KRTAP9-3Q9BYQ3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
KRTAP9-3Q9BYQ3 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
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KRTAP9-3Q9BYQ3 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
KRTAP9-3Q9BYQ3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
KRTAP9-3Q9BYQ3 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
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KRTAP9-3Q9BYQ3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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KRTAP9-3Q9BYQ3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
KRTAP9-3Q9BYQ3 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
KRTAP9-3Q9BYQ3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
KRTAP9-3Q9BYQ3 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
KRTAP9-3Q9BYQ3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
KRTAP9-3Q9BYQ3 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
KRTAP9-3Q9BYQ3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
KRTAP9-3Q9BYQ3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
KRTAP9-3Q9BYQ3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
KRTAP9-3Q9BYQ3 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC00437-201ENST00000414161 791 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
KRTAP9-3Q9BYQ3 IL12A-202ENST00000466512 1283 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
KRTAP9-3Q9BYQ3 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
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