Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY11

PACSIN1, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN1Q9BY11 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PACSIN1Q9BY11 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PACSIN1Q9BY11 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PACSIN1Q9BY11 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PACSIN1Q9BY11 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PACSIN1Q9BY11 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PACSIN1Q9BY11 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PACSIN1Q9BY11 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PACSIN1Q9BY11 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PACSIN1Q9BY11 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PACSIN1Q9BY11 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.47
PACSIN1Q9BY11 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PACSIN1Q9BY11 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PACSIN1Q9BY11 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PACSIN1Q9BY11 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PACSIN1Q9BY11 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PACSIN1Q9BY11 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PACSIN1Q9BY11 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PACSIN1Q9BY11 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PACSIN1Q9BY11 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PACSIN1Q9BY11 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PACSIN1Q9BY11 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PACSIN1Q9BY11 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PACSIN1Q9BY11 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PACSIN1Q9BY11 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PACSIN1Q9BY11 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PACSIN1Q9BY11 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PACSIN1Q9BY11 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PACSIN1Q9BY11 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PACSIN1Q9BY11 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PACSIN1Q9BY11 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PACSIN1Q9BY11 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PACSIN1Q9BY11 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PACSIN1Q9BY11 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PACSIN1Q9BY11 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PACSIN1Q9BY11 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PACSIN1Q9BY11 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PACSIN1Q9BY11 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PACSIN1Q9BY11 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PACSIN1Q9BY11 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PACSIN1Q9BY11 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PACSIN1Q9BY11 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PACSIN1Q9BY11 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PACSIN1Q9BY11 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PACSIN1Q9BY11 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PACSIN1Q9BY11 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PACSIN1Q9BY11 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PACSIN1Q9BY11 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PACSIN1Q9BY11 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PACSIN1Q9BY11 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PACSIN1Q9BY11 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PACSIN1Q9BY11 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PACSIN1Q9BY11 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PACSIN1Q9BY11 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PACSIN1Q9BY11 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PACSIN1Q9BY11 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PACSIN1Q9BY11 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PACSIN1Q9BY11 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PACSIN1Q9BY11 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PACSIN1Q9BY11 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PACSIN1Q9BY11 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PACSIN1Q9BY11 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PACSIN1Q9BY11 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PACSIN1Q9BY11 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PACSIN1Q9BY11 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PACSIN1Q9BY11 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PACSIN1Q9BY11 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PACSIN1Q9BY11 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PACSIN1Q9BY11 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PACSIN1Q9BY11 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PACSIN1Q9BY11 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PACSIN1Q9BY11 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PACSIN1Q9BY11 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PACSIN1Q9BY11 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PACSIN1Q9BY11 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PACSIN1Q9BY11 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PACSIN1Q9BY11 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PACSIN1Q9BY11 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PACSIN1Q9BY11 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PACSIN1Q9BY11 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PACSIN1Q9BY11 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PACSIN1Q9BY11 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PACSIN1Q9BY11 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PACSIN1Q9BY11 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PACSIN1Q9BY11 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PACSIN1Q9BY11 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PACSIN1Q9BY11 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PACSIN1Q9BY11 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PACSIN1Q9BY11 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PACSIN1Q9BY11 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PACSIN1Q9BY11 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PACSIN1Q9BY11 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PACSIN1Q9BY11 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PACSIN1Q9BY11 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PACSIN1Q9BY11 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PACSIN1Q9BY11 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PACSIN1Q9BY11 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PACSIN1Q9BY11 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PACSIN1Q9BY11 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PACSIN1Q9BY11 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.1 ms