Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SGIP1Q9BQI5 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SGIP1Q9BQI5 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SGIP1Q9BQI5 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
SGIP1Q9BQI5 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SGIP1Q9BQI5 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SGIP1Q9BQI5 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SGIP1Q9BQI5 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
SGIP1Q9BQI5 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SGIP1Q9BQI5 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SGIP1Q9BQI5 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
SGIP1Q9BQI5 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
SGIP1Q9BQI5 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SGIP1Q9BQI5 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SGIP1Q9BQI5 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SGIP1Q9BQI5 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
SGIP1Q9BQI5 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
SGIP1Q9BQI5 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SGIP1Q9BQI5 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SGIP1Q9BQI5 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SGIP1Q9BQI5 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SGIP1Q9BQI5 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SGIP1Q9BQI5 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
SGIP1Q9BQI5 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SGIP1Q9BQI5 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SGIP1Q9BQI5 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SGIP1Q9BQI5 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SGIP1Q9BQI5 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SGIP1Q9BQI5 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SGIP1Q9BQI5 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
SGIP1Q9BQI5 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SGIP1Q9BQI5 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SGIP1Q9BQI5 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SGIP1Q9BQI5 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SGIP1Q9BQI5 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SGIP1Q9BQI5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SGIP1Q9BQI5 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SGIP1Q9BQI5 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SGIP1Q9BQI5 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SGIP1Q9BQI5 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SGIP1Q9BQI5 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
SGIP1Q9BQI5 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SGIP1Q9BQI5 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SGIP1Q9BQI5 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SGIP1Q9BQI5 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SGIP1Q9BQI5 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SGIP1Q9BQI5 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
SGIP1Q9BQI5 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SGIP1Q9BQI5 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SGIP1Q9BQI5 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SGIP1Q9BQI5 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SGIP1Q9BQI5 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SGIP1Q9BQI5 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SGIP1Q9BQI5 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SGIP1Q9BQI5 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SGIP1Q9BQI5 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SGIP1Q9BQI5 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SGIP1Q9BQI5 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SGIP1Q9BQI5 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SGIP1Q9BQI5 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SGIP1Q9BQI5 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SGIP1Q9BQI5 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SGIP1Q9BQI5 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SGIP1Q9BQI5 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SGIP1Q9BQI5 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SGIP1Q9BQI5 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SGIP1Q9BQI5 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SGIP1Q9BQI5 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SGIP1Q9BQI5 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SGIP1Q9BQI5 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SGIP1Q9BQI5 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SGIP1Q9BQI5 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SGIP1Q9BQI5 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SGIP1Q9BQI5 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
SGIP1Q9BQI5 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
SGIP1Q9BQI5 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
SGIP1Q9BQI5 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
SGIP1Q9BQI5 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SGIP1Q9BQI5 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SGIP1Q9BQI5 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
SGIP1Q9BQI5 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SGIP1Q9BQI5 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SGIP1Q9BQI5 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SGIP1Q9BQI5 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SGIP1Q9BQI5 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SGIP1Q9BQI5 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SGIP1Q9BQI5 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SGIP1Q9BQI5 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SGIP1Q9BQI5 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SGIP1Q9BQI5 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SGIP1Q9BQI5 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SGIP1Q9BQI5 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
SGIP1Q9BQI5 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
SGIP1Q9BQI5 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SGIP1Q9BQI5 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SGIP1Q9BQI5 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
SGIP1Q9BQI5 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
SGIP1Q9BQI5 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SGIP1Q9BQI5 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SGIP1Q9BQI5 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms