Protein–RNA interactions for Protein: Q99618

CDCA3, Cell division cycle-associated protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA3Q99618 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDCA3Q99618 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CDCA3Q99618 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDCA3Q99618 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDCA3Q99618 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDCA3Q99618 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDCA3Q99618 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDCA3Q99618 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDCA3Q99618 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDCA3Q99618 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDCA3Q99618 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDCA3Q99618 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDCA3Q99618 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDCA3Q99618 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDCA3Q99618 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDCA3Q99618 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDCA3Q99618 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CDCA3Q99618 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDCA3Q99618 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDCA3Q99618 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDCA3Q99618 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDCA3Q99618 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDCA3Q99618 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDCA3Q99618 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDCA3Q99618 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDCA3Q99618 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CDCA3Q99618 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDCA3Q99618 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDCA3Q99618 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDCA3Q99618 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDCA3Q99618 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDCA3Q99618 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CDCA3Q99618 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDCA3Q99618 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDCA3Q99618 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CDCA3Q99618 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CDCA3Q99618 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CDCA3Q99618 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CDCA3Q99618 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CDCA3Q99618 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDCA3Q99618 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDCA3Q99618 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDCA3Q99618 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDCA3Q99618 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDCA3Q99618 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDCA3Q99618 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDCA3Q99618 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDCA3Q99618 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDCA3Q99618 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDCA3Q99618 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CDCA3Q99618 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CDCA3Q99618 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CDCA3Q99618 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDCA3Q99618 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CDCA3Q99618 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDCA3Q99618 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CDCA3Q99618 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CDCA3Q99618 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24■■□□□ 1.43
CDCA3Q99618 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CDCA3Q99618 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CDCA3Q99618 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CDCA3Q99618 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CDCA3Q99618 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CDCA3Q99618 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CDCA3Q99618 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CDCA3Q99618 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CDCA3Q99618 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDCA3Q99618 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CDCA3Q99618 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDCA3Q99618 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDCA3Q99618 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDCA3Q99618 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDCA3Q99618 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDCA3Q99618 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDCA3Q99618 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CDCA3Q99618 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDCA3Q99618 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDCA3Q99618 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDCA3Q99618 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDCA3Q99618 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CDCA3Q99618 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDCA3Q99618 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDCA3Q99618 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDCA3Q99618 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CDCA3Q99618 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDCA3Q99618 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDCA3Q99618 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDCA3Q99618 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDCA3Q99618 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDCA3Q99618 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDCA3Q99618 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDCA3Q99618 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDCA3Q99618 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDCA3Q99618 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDCA3Q99618 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDCA3Q99618 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDCA3Q99618 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDCA3Q99618 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDCA3Q99618 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDCA3Q99618 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms