Protein–RNA interactions for Protein: Q96MR9

ZNF560, Zinc finger protein 560, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF560Q96MR9 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF560Q96MR9 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ZNF560Q96MR9 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ZNF560Q96MR9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ZNF560Q96MR9 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
ZNF560Q96MR9 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF560Q96MR9 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF560Q96MR9 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF560Q96MR9 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF560Q96MR9 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF560Q96MR9 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF560Q96MR9 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF560Q96MR9 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF560Q96MR9 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF560Q96MR9 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF560Q96MR9 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF560Q96MR9 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF560Q96MR9 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF560Q96MR9 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF560Q96MR9 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF560Q96MR9 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF560Q96MR9 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF560Q96MR9 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF560Q96MR9 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF560Q96MR9 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF560Q96MR9 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF560Q96MR9 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF560Q96MR9 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF560Q96MR9 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF560Q96MR9 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF560Q96MR9 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF560Q96MR9 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF560Q96MR9 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF560Q96MR9 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF560Q96MR9 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF560Q96MR9 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF560Q96MR9 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF560Q96MR9 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF560Q96MR9 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF560Q96MR9 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF560Q96MR9 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF560Q96MR9 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF560Q96MR9 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF560Q96MR9 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF560Q96MR9 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF560Q96MR9 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF560Q96MR9 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF560Q96MR9 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF560Q96MR9 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF560Q96MR9 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF560Q96MR9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZNF560Q96MR9 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZNF560Q96MR9 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZNF560Q96MR9 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZNF560Q96MR9 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZNF560Q96MR9 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNF560Q96MR9 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNF560Q96MR9 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNF560Q96MR9 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNF560Q96MR9 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNF560Q96MR9 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNF560Q96MR9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF560Q96MR9 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF560Q96MR9 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF560Q96MR9 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF560Q96MR9 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF560Q96MR9 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF560Q96MR9 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF560Q96MR9 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF560Q96MR9 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF560Q96MR9 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF560Q96MR9 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF560Q96MR9 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF560Q96MR9 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF560Q96MR9 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF560Q96MR9 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF560Q96MR9 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF560Q96MR9 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF560Q96MR9 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF560Q96MR9 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF560Q96MR9 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF560Q96MR9 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF560Q96MR9 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF560Q96MR9 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF560Q96MR9 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF560Q96MR9 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF560Q96MR9 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF560Q96MR9 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF560Q96MR9 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF560Q96MR9 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF560Q96MR9 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF560Q96MR9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF560Q96MR9 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF560Q96MR9 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF560Q96MR9 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF560Q96MR9 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF560Q96MR9 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF560Q96MR9 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF560Q96MR9 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF560Q96MR9 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 169.9 ms