Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDI0

CHD5, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,954 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD5Q8TDI0 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHD5Q8TDI0 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHD5Q8TDI0 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHD5Q8TDI0 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHD5Q8TDI0 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHD5Q8TDI0 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHD5Q8TDI0 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHD5Q8TDI0 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHD5Q8TDI0 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHD5Q8TDI0 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHD5Q8TDI0 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHD5Q8TDI0 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHD5Q8TDI0 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHD5Q8TDI0 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHD5Q8TDI0 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHD5Q8TDI0 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHD5Q8TDI0 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHD5Q8TDI0 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHD5Q8TDI0 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHD5Q8TDI0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHD5Q8TDI0 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHD5Q8TDI0 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHD5Q8TDI0 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHD5Q8TDI0 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHD5Q8TDI0 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHD5Q8TDI0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHD5Q8TDI0 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHD5Q8TDI0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHD5Q8TDI0 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHD5Q8TDI0 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHD5Q8TDI0 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHD5Q8TDI0 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHD5Q8TDI0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHD5Q8TDI0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHD5Q8TDI0 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHD5Q8TDI0 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHD5Q8TDI0 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHD5Q8TDI0 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHD5Q8TDI0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHD5Q8TDI0 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHD5Q8TDI0 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHD5Q8TDI0 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHD5Q8TDI0 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHD5Q8TDI0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHD5Q8TDI0 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHD5Q8TDI0 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHD5Q8TDI0 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHD5Q8TDI0 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHD5Q8TDI0 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHD5Q8TDI0 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHD5Q8TDI0 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHD5Q8TDI0 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHD5Q8TDI0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHD5Q8TDI0 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHD5Q8TDI0 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHD5Q8TDI0 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHD5Q8TDI0 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CHD5Q8TDI0 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHD5Q8TDI0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHD5Q8TDI0 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHD5Q8TDI0 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHD5Q8TDI0 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHD5Q8TDI0 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHD5Q8TDI0 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
CHD5Q8TDI0 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
CHD5Q8TDI0 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
CHD5Q8TDI0 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHD5Q8TDI0 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHD5Q8TDI0 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHD5Q8TDI0 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CHD5Q8TDI0 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHD5Q8TDI0 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHD5Q8TDI0 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHD5Q8TDI0 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHD5Q8TDI0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHD5Q8TDI0 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHD5Q8TDI0 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHD5Q8TDI0 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHD5Q8TDI0 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHD5Q8TDI0 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHD5Q8TDI0 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHD5Q8TDI0 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHD5Q8TDI0 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHD5Q8TDI0 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHD5Q8TDI0 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHD5Q8TDI0 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHD5Q8TDI0 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHD5Q8TDI0 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHD5Q8TDI0 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHD5Q8TDI0 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHD5Q8TDI0 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHD5Q8TDI0 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHD5Q8TDI0 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHD5Q8TDI0 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHD5Q8TDI0 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHD5Q8TDI0 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHD5Q8TDI0 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHD5Q8TDI0 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHD5Q8TDI0 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHD5Q8TDI0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.9 ms