Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAE3

LINC01555, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01555, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01555Q8NAE3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LINC01555Q8NAE3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LINC01555Q8NAE3 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LINC01555Q8NAE3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LINC01555Q8NAE3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LINC01555Q8NAE3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LINC01555Q8NAE3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LINC01555Q8NAE3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LINC01555Q8NAE3 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LINC01555Q8NAE3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LINC01555Q8NAE3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LINC01555Q8NAE3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LINC01555Q8NAE3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LINC01555Q8NAE3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LINC01555Q8NAE3 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LINC01555Q8NAE3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LINC01555Q8NAE3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LINC01555Q8NAE3 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LINC01555Q8NAE3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LINC01555Q8NAE3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LINC01555Q8NAE3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LINC01555Q8NAE3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LINC01555Q8NAE3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LINC01555Q8NAE3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LINC01555Q8NAE3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LINC01555Q8NAE3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LINC01555Q8NAE3 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LINC01555Q8NAE3 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LINC01555Q8NAE3 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LINC01555Q8NAE3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LINC01555Q8NAE3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LINC01555Q8NAE3 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LINC01555Q8NAE3 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LINC01555Q8NAE3 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LINC01555Q8NAE3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LINC01555Q8NAE3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LINC01555Q8NAE3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LINC01555Q8NAE3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LINC01555Q8NAE3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LINC01555Q8NAE3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LINC01555Q8NAE3 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LINC01555Q8NAE3 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
LINC01555Q8NAE3 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LINC01555Q8NAE3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LINC01555Q8NAE3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
LINC01555Q8NAE3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LINC01555Q8NAE3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LINC01555Q8NAE3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LINC01555Q8NAE3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LINC01555Q8NAE3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LINC01555Q8NAE3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LINC01555Q8NAE3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LINC01555Q8NAE3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LINC01555Q8NAE3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LINC01555Q8NAE3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LINC01555Q8NAE3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LINC01555Q8NAE3 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LINC01555Q8NAE3 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LINC01555Q8NAE3 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LINC01555Q8NAE3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LINC01555Q8NAE3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LINC01555Q8NAE3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LINC01555Q8NAE3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LINC01555Q8NAE3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LINC01555Q8NAE3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LINC01555Q8NAE3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LINC01555Q8NAE3 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LINC01555Q8NAE3 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LINC01555Q8NAE3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LINC01555Q8NAE3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
LINC01555Q8NAE3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LINC01555Q8NAE3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LINC01555Q8NAE3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LINC01555Q8NAE3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LINC01555Q8NAE3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LINC01555Q8NAE3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LINC01555Q8NAE3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LINC01555Q8NAE3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LINC01555Q8NAE3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LINC01555Q8NAE3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LINC01555Q8NAE3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
LINC01555Q8NAE3 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LINC01555Q8NAE3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LINC01555Q8NAE3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LINC01555Q8NAE3 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LINC01555Q8NAE3 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LINC01555Q8NAE3 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LINC01555Q8NAE3 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LINC01555Q8NAE3 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LINC01555Q8NAE3 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LINC01555Q8NAE3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LINC01555Q8NAE3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LINC01555Q8NAE3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LINC01555Q8NAE3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LINC01555Q8NAE3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LINC01555Q8NAE3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LINC01555Q8NAE3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LINC01555Q8NAE3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LINC01555Q8NAE3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LINC01555Q8NAE3 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms