Protein–RNA interactions for Protein: Q8N137

CNTROB, Centrobin, humanhuman

Predictions only

Length 903 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTROBQ8N137 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CNTROBQ8N137 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CNTROBQ8N137 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CNTROBQ8N137 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CNTROBQ8N137 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CNTROBQ8N137 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CNTROBQ8N137 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CNTROBQ8N137 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CNTROBQ8N137 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CNTROBQ8N137 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CNTROBQ8N137 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CNTROBQ8N137 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CNTROBQ8N137 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CNTROBQ8N137 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CNTROBQ8N137 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CNTROBQ8N137 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CNTROBQ8N137 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
CNTROBQ8N137 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
CNTROBQ8N137 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CNTROBQ8N137 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CNTROBQ8N137 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CNTROBQ8N137 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CNTROBQ8N137 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CNTROBQ8N137 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CNTROBQ8N137 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CNTROBQ8N137 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CNTROBQ8N137 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CNTROBQ8N137 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CNTROBQ8N137 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CNTROBQ8N137 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CNTROBQ8N137 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.13
CNTROBQ8N137 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CNTROBQ8N137 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
CNTROBQ8N137 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CNTROBQ8N137 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
CNTROBQ8N137 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CNTROBQ8N137 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CNTROBQ8N137 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CNTROBQ8N137 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CNTROBQ8N137 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
CNTROBQ8N137 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CNTROBQ8N137 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CNTROBQ8N137 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CNTROBQ8N137 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CNTROBQ8N137 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CNTROBQ8N137 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CNTROBQ8N137 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CNTROBQ8N137 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CNTROBQ8N137 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CNTROBQ8N137 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CNTROBQ8N137 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CNTROBQ8N137 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CNTROBQ8N137 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CNTROBQ8N137 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
CNTROBQ8N137 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CNTROBQ8N137 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CNTROBQ8N137 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CNTROBQ8N137 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
CNTROBQ8N137 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CNTROBQ8N137 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CNTROBQ8N137 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CNTROBQ8N137 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CNTROBQ8N137 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CNTROBQ8N137 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CNTROBQ8N137 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CNTROBQ8N137 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CNTROBQ8N137 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
CNTROBQ8N137 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CNTROBQ8N137 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CNTROBQ8N137 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CNTROBQ8N137 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CNTROBQ8N137 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CNTROBQ8N137 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
CNTROBQ8N137 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CNTROBQ8N137 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CNTROBQ8N137 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CNTROBQ8N137 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CNTROBQ8N137 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CNTROBQ8N137 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CNTROBQ8N137 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CNTROBQ8N137 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
CNTROBQ8N137 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CNTROBQ8N137 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CNTROBQ8N137 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CNTROBQ8N137 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CNTROBQ8N137 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CNTROBQ8N137 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CNTROBQ8N137 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
CNTROBQ8N137 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CNTROBQ8N137 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CNTROBQ8N137 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CNTROBQ8N137 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CNTROBQ8N137 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CNTROBQ8N137 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CNTROBQ8N137 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CNTROBQ8N137 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CNTROBQ8N137 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CNTROBQ8N137 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CNTROBQ8N137 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CNTROBQ8N137 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.6 ms