Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMN8

CCNI2, Cyclin-I2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNI2Q6ZMN8 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCNI2Q6ZMN8 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCNI2Q6ZMN8 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCNI2Q6ZMN8 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCNI2Q6ZMN8 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCNI2Q6ZMN8 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CCNI2Q6ZMN8 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCNI2Q6ZMN8 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCNI2Q6ZMN8 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCNI2Q6ZMN8 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCNI2Q6ZMN8 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCNI2Q6ZMN8 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCNI2Q6ZMN8 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCNI2Q6ZMN8 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCNI2Q6ZMN8 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCNI2Q6ZMN8 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCNI2Q6ZMN8 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCNI2Q6ZMN8 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCNI2Q6ZMN8 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCNI2Q6ZMN8 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCNI2Q6ZMN8 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCNI2Q6ZMN8 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCNI2Q6ZMN8 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCNI2Q6ZMN8 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCNI2Q6ZMN8 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CCNI2Q6ZMN8 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCNI2Q6ZMN8 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCNI2Q6ZMN8 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCNI2Q6ZMN8 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCNI2Q6ZMN8 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCNI2Q6ZMN8 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCNI2Q6ZMN8 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCNI2Q6ZMN8 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCNI2Q6ZMN8 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCNI2Q6ZMN8 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCNI2Q6ZMN8 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCNI2Q6ZMN8 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCNI2Q6ZMN8 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCNI2Q6ZMN8 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCNI2Q6ZMN8 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCNI2Q6ZMN8 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCNI2Q6ZMN8 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCNI2Q6ZMN8 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCNI2Q6ZMN8 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCNI2Q6ZMN8 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCNI2Q6ZMN8 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCNI2Q6ZMN8 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCNI2Q6ZMN8 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCNI2Q6ZMN8 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCNI2Q6ZMN8 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCNI2Q6ZMN8 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCNI2Q6ZMN8 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CCNI2Q6ZMN8 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCNI2Q6ZMN8 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCNI2Q6ZMN8 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCNI2Q6ZMN8 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCNI2Q6ZMN8 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCNI2Q6ZMN8 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCNI2Q6ZMN8 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCNI2Q6ZMN8 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCNI2Q6ZMN8 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCNI2Q6ZMN8 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCNI2Q6ZMN8 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CCNI2Q6ZMN8 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCNI2Q6ZMN8 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCNI2Q6ZMN8 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCNI2Q6ZMN8 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CCNI2Q6ZMN8 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCNI2Q6ZMN8 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCNI2Q6ZMN8 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCNI2Q6ZMN8 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CCNI2Q6ZMN8 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCNI2Q6ZMN8 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CCNI2Q6ZMN8 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCNI2Q6ZMN8 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCNI2Q6ZMN8 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CCNI2Q6ZMN8 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCNI2Q6ZMN8 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCNI2Q6ZMN8 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CCNI2Q6ZMN8 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCNI2Q6ZMN8 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCNI2Q6ZMN8 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
CCNI2Q6ZMN8 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCNI2Q6ZMN8 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCNI2Q6ZMN8 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCNI2Q6ZMN8 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCNI2Q6ZMN8 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CCNI2Q6ZMN8 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CCNI2Q6ZMN8 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCNI2Q6ZMN8 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CCNI2Q6ZMN8 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CCNI2Q6ZMN8 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCNI2Q6ZMN8 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCNI2Q6ZMN8 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCNI2Q6ZMN8 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCNI2Q6ZMN8 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCNI2Q6ZMN8 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCNI2Q6ZMN8 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCNI2Q6ZMN8 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCNI2Q6ZMN8 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms