Protein–RNA interactions for Protein: Q6XPR3

RPTN, Repetin, humanhuman

Predictions only

Length 784 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPTNQ6XPR3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
RPTNQ6XPR3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
RPTNQ6XPR3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPTNQ6XPR3 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPTNQ6XPR3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RPTNQ6XPR3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RPTNQ6XPR3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RPTNQ6XPR3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RPTNQ6XPR3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RPTNQ6XPR3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RPTNQ6XPR3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RPTNQ6XPR3 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
RPTNQ6XPR3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RPTNQ6XPR3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RPTNQ6XPR3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RPTNQ6XPR3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RPTNQ6XPR3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RPTNQ6XPR3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RPTNQ6XPR3 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RPTNQ6XPR3 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RPTNQ6XPR3 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RPTNQ6XPR3 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RPTNQ6XPR3 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RPTNQ6XPR3 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RPTNQ6XPR3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RPTNQ6XPR3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RPTNQ6XPR3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
RPTNQ6XPR3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RPTNQ6XPR3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
RPTNQ6XPR3 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RPTNQ6XPR3 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RPTNQ6XPR3 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RPTNQ6XPR3 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RPTNQ6XPR3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
RPTNQ6XPR3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RPTNQ6XPR3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RPTNQ6XPR3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RPTNQ6XPR3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RPTNQ6XPR3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RPTNQ6XPR3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RPTNQ6XPR3 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RPTNQ6XPR3 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RPTNQ6XPR3 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RPTNQ6XPR3 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RPTNQ6XPR3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RPTNQ6XPR3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RPTNQ6XPR3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RPTNQ6XPR3 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RPTNQ6XPR3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RPTNQ6XPR3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
RPTNQ6XPR3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RPTNQ6XPR3 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RPTNQ6XPR3 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RPTNQ6XPR3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RPTNQ6XPR3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
RPTNQ6XPR3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
RPTNQ6XPR3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RPTNQ6XPR3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RPTNQ6XPR3 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RPTNQ6XPR3 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RPTNQ6XPR3 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RPTNQ6XPR3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RPTNQ6XPR3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RPTNQ6XPR3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RPTNQ6XPR3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RPTNQ6XPR3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RPTNQ6XPR3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RPTNQ6XPR3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
RPTNQ6XPR3 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
RPTNQ6XPR3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
RPTNQ6XPR3 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RPTNQ6XPR3 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
RPTNQ6XPR3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RPTNQ6XPR3 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
RPTNQ6XPR3 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
RPTNQ6XPR3 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
RPTNQ6XPR3 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21■□□□□ 0.95
RPTNQ6XPR3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RPTNQ6XPR3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RPTNQ6XPR3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
RPTNQ6XPR3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RPTNQ6XPR3 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RPTNQ6XPR3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RPTNQ6XPR3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
RPTNQ6XPR3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RPTNQ6XPR3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPTNQ6XPR3 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPTNQ6XPR3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPTNQ6XPR3 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPTNQ6XPR3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPTNQ6XPR3 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPTNQ6XPR3 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPTNQ6XPR3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPTNQ6XPR3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPTNQ6XPR3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPTNQ6XPR3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPTNQ6XPR3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPTNQ6XPR3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPTNQ6XPR3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RPTNQ6XPR3 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.5 ms