Protein–RNA interactions for Protein: Q6XLA1

CASC2, Protein CASC2, isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC2Q6XLA1 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CASC2Q6XLA1 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CASC2Q6XLA1 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CASC2Q6XLA1 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CASC2Q6XLA1 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CASC2Q6XLA1 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CASC2Q6XLA1 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CASC2Q6XLA1 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CASC2Q6XLA1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CASC2Q6XLA1 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CASC2Q6XLA1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CASC2Q6XLA1 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
CASC2Q6XLA1 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CASC2Q6XLA1 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
CASC2Q6XLA1 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CASC2Q6XLA1 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CASC2Q6XLA1 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CASC2Q6XLA1 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CASC2Q6XLA1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CASC2Q6XLA1 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CASC2Q6XLA1 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CASC2Q6XLA1 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CASC2Q6XLA1 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CASC2Q6XLA1 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CASC2Q6XLA1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CASC2Q6XLA1 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CASC2Q6XLA1 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CASC2Q6XLA1 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CASC2Q6XLA1 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CASC2Q6XLA1 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CASC2Q6XLA1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CASC2Q6XLA1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CASC2Q6XLA1 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CASC2Q6XLA1 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CASC2Q6XLA1 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CASC2Q6XLA1 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CASC2Q6XLA1 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CASC2Q6XLA1 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CASC2Q6XLA1 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CASC2Q6XLA1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CASC2Q6XLA1 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CASC2Q6XLA1 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CASC2Q6XLA1 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CASC2Q6XLA1 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CASC2Q6XLA1 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CASC2Q6XLA1 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CASC2Q6XLA1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CASC2Q6XLA1 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CASC2Q6XLA1 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CASC2Q6XLA1 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CASC2Q6XLA1 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CASC2Q6XLA1 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CASC2Q6XLA1 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CASC2Q6XLA1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CASC2Q6XLA1 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CASC2Q6XLA1 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CASC2Q6XLA1 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
CASC2Q6XLA1 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CASC2Q6XLA1 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CASC2Q6XLA1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CASC2Q6XLA1 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
CASC2Q6XLA1 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CASC2Q6XLA1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CASC2Q6XLA1 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CASC2Q6XLA1 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CASC2Q6XLA1 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CASC2Q6XLA1 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CASC2Q6XLA1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CASC2Q6XLA1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CASC2Q6XLA1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CASC2Q6XLA1 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CASC2Q6XLA1 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CASC2Q6XLA1 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
CASC2Q6XLA1 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
CASC2Q6XLA1 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
CASC2Q6XLA1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
CASC2Q6XLA1 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
CASC2Q6XLA1 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CASC2Q6XLA1 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CASC2Q6XLA1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CASC2Q6XLA1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CASC2Q6XLA1 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CASC2Q6XLA1 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CASC2Q6XLA1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CASC2Q6XLA1 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CASC2Q6XLA1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CASC2Q6XLA1 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CASC2Q6XLA1 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CASC2Q6XLA1 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
CASC2Q6XLA1 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CASC2Q6XLA1 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CASC2Q6XLA1 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CASC2Q6XLA1 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CASC2Q6XLA1 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CASC2Q6XLA1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
CASC2Q6XLA1 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CASC2Q6XLA1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CASC2Q6XLA1 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CASC2Q6XLA1 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
CASC2Q6XLA1 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms