Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUM1

SDHAF4, Succinate dehydrogenase assembly factor 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHAF4Q5VUM1 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SDHAF4Q5VUM1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SDHAF4Q5VUM1 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SDHAF4Q5VUM1 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SDHAF4Q5VUM1 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SDHAF4Q5VUM1 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SDHAF4Q5VUM1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SDHAF4Q5VUM1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SDHAF4Q5VUM1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SDHAF4Q5VUM1 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SDHAF4Q5VUM1 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SDHAF4Q5VUM1 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SDHAF4Q5VUM1 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SDHAF4Q5VUM1 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SDHAF4Q5VUM1 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SDHAF4Q5VUM1 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SDHAF4Q5VUM1 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SDHAF4Q5VUM1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SDHAF4Q5VUM1 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SDHAF4Q5VUM1 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SDHAF4Q5VUM1 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SDHAF4Q5VUM1 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SDHAF4Q5VUM1 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SDHAF4Q5VUM1 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SDHAF4Q5VUM1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SDHAF4Q5VUM1 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SDHAF4Q5VUM1 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SDHAF4Q5VUM1 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SDHAF4Q5VUM1 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SDHAF4Q5VUM1 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SDHAF4Q5VUM1 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SDHAF4Q5VUM1 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SDHAF4Q5VUM1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SDHAF4Q5VUM1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SDHAF4Q5VUM1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SDHAF4Q5VUM1 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SDHAF4Q5VUM1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SDHAF4Q5VUM1 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SDHAF4Q5VUM1 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SDHAF4Q5VUM1 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SDHAF4Q5VUM1 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SDHAF4Q5VUM1 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SDHAF4Q5VUM1 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SDHAF4Q5VUM1 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SDHAF4Q5VUM1 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SDHAF4Q5VUM1 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SDHAF4Q5VUM1 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SDHAF4Q5VUM1 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SDHAF4Q5VUM1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SDHAF4Q5VUM1 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SDHAF4Q5VUM1 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SDHAF4Q5VUM1 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SDHAF4Q5VUM1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SDHAF4Q5VUM1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SDHAF4Q5VUM1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SDHAF4Q5VUM1 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SDHAF4Q5VUM1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SDHAF4Q5VUM1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SDHAF4Q5VUM1 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SDHAF4Q5VUM1 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SDHAF4Q5VUM1 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SDHAF4Q5VUM1 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SDHAF4Q5VUM1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SDHAF4Q5VUM1 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SDHAF4Q5VUM1 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SDHAF4Q5VUM1 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SDHAF4Q5VUM1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SDHAF4Q5VUM1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SDHAF4Q5VUM1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SDHAF4Q5VUM1 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SDHAF4Q5VUM1 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SDHAF4Q5VUM1 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SDHAF4Q5VUM1 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SDHAF4Q5VUM1 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SDHAF4Q5VUM1 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SDHAF4Q5VUM1 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SDHAF4Q5VUM1 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SDHAF4Q5VUM1 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SDHAF4Q5VUM1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SDHAF4Q5VUM1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SDHAF4Q5VUM1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SDHAF4Q5VUM1 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SDHAF4Q5VUM1 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SDHAF4Q5VUM1 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SDHAF4Q5VUM1 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SDHAF4Q5VUM1 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SDHAF4Q5VUM1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SDHAF4Q5VUM1 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SDHAF4Q5VUM1 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SDHAF4Q5VUM1 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SDHAF4Q5VUM1 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SDHAF4Q5VUM1 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SDHAF4Q5VUM1 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SDHAF4Q5VUM1 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SDHAF4Q5VUM1 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SDHAF4Q5VUM1 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SDHAF4Q5VUM1 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SDHAF4Q5VUM1 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SDHAF4Q5VUM1 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SDHAF4Q5VUM1 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms