Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWL8

PRAMEF19, PRAME family member 19, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF19Q5SWL8 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRAMEF19Q5SWL8 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRAMEF19Q5SWL8 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PRAMEF19Q5SWL8 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRAMEF19Q5SWL8 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRAMEF19Q5SWL8 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRAMEF19Q5SWL8 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRAMEF19Q5SWL8 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRAMEF19Q5SWL8 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRAMEF19Q5SWL8 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRAMEF19Q5SWL8 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRAMEF19Q5SWL8 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PRAMEF19Q5SWL8 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRAMEF19Q5SWL8 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRAMEF19Q5SWL8 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRAMEF19Q5SWL8 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRAMEF19Q5SWL8 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PRAMEF19Q5SWL8 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRAMEF19Q5SWL8 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRAMEF19Q5SWL8 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRAMEF19Q5SWL8 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PRAMEF19Q5SWL8 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRAMEF19Q5SWL8 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRAMEF19Q5SWL8 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRAMEF19Q5SWL8 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRAMEF19Q5SWL8 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRAMEF19Q5SWL8 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRAMEF19Q5SWL8 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRAMEF19Q5SWL8 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRAMEF19Q5SWL8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRAMEF19Q5SWL8 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRAMEF19Q5SWL8 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRAMEF19Q5SWL8 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRAMEF19Q5SWL8 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRAMEF19Q5SWL8 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRAMEF19Q5SWL8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRAMEF19Q5SWL8 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRAMEF19Q5SWL8 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRAMEF19Q5SWL8 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRAMEF19Q5SWL8 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PRAMEF19Q5SWL8 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRAMEF19Q5SWL8 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRAMEF19Q5SWL8 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRAMEF19Q5SWL8 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRAMEF19Q5SWL8 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRAMEF19Q5SWL8 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRAMEF19Q5SWL8 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRAMEF19Q5SWL8 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRAMEF19Q5SWL8 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRAMEF19Q5SWL8 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRAMEF19Q5SWL8 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRAMEF19Q5SWL8 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRAMEF19Q5SWL8 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRAMEF19Q5SWL8 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRAMEF19Q5SWL8 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRAMEF19Q5SWL8 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRAMEF19Q5SWL8 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRAMEF19Q5SWL8 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRAMEF19Q5SWL8 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRAMEF19Q5SWL8 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRAMEF19Q5SWL8 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRAMEF19Q5SWL8 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PRAMEF19Q5SWL8 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PRAMEF19Q5SWL8 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PRAMEF19Q5SWL8 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PRAMEF19Q5SWL8 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRAMEF19Q5SWL8 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PRAMEF19Q5SWL8 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRAMEF19Q5SWL8 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRAMEF19Q5SWL8 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRAMEF19Q5SWL8 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PRAMEF19Q5SWL8 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PRAMEF19Q5SWL8 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PRAMEF19Q5SWL8 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRAMEF19Q5SWL8 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRAMEF19Q5SWL8 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRAMEF19Q5SWL8 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRAMEF19Q5SWL8 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PRAMEF19Q5SWL8 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRAMEF19Q5SWL8 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRAMEF19Q5SWL8 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRAMEF19Q5SWL8 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRAMEF19Q5SWL8 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRAMEF19Q5SWL8 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PRAMEF19Q5SWL8 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRAMEF19Q5SWL8 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRAMEF19Q5SWL8 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRAMEF19Q5SWL8 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRAMEF19Q5SWL8 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRAMEF19Q5SWL8 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRAMEF19Q5SWL8 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PRAMEF19Q5SWL8 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRAMEF19Q5SWL8 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PRAMEF19Q5SWL8 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRAMEF19Q5SWL8 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRAMEF19Q5SWL8 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRAMEF19Q5SWL8 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRAMEF19Q5SWL8 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRAMEF19Q5SWL8 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRAMEF19Q5SWL8 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms