Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYF9

KRTAP19-7, Keratin-associated protein 19-7, humanhuman

Predictions only

Length 63 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP19-7Q3SYF9 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.49□□□□□ -1.05
KRTAP19-7Q3SYF9 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
KRTAP19-7Q3SYF9 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.49□□□□□ -1.05
KRTAP19-7Q3SYF9 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
KRTAP19-7Q3SYF9 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
KRTAP19-7Q3SYF9 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
KRTAP19-7Q3SYF9 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
KRTAP19-7Q3SYF9 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
KRTAP19-7Q3SYF9 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
KRTAP19-7Q3SYF9 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
KRTAP19-7Q3SYF9 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
KRTAP19-7Q3SYF9 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
KRTAP19-7Q3SYF9 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
KRTAP19-7Q3SYF9 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
KRTAP19-7Q3SYF9 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC8.48□□□□□ -1.05
KRTAP19-7Q3SYF9 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
KRTAP19-7Q3SYF9 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
KRTAP19-7Q3SYF9 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
KRTAP19-7Q3SYF9 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
KRTAP19-7Q3SYF9 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC8.48□□□□□ -1.05
KRTAP19-7Q3SYF9 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
KRTAP19-7Q3SYF9 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
KRTAP19-7Q3SYF9 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
KRTAP19-7Q3SYF9 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
KRTAP19-7Q3SYF9 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
KRTAP19-7Q3SYF9 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
KRTAP19-7Q3SYF9 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
KRTAP19-7Q3SYF9 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
KRTAP19-7Q3SYF9 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
KRTAP19-7Q3SYF9 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
KRTAP19-7Q3SYF9 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
KRTAP19-7Q3SYF9 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
KRTAP19-7Q3SYF9 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
KRTAP19-7Q3SYF9 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
KRTAP19-7Q3SYF9 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
KRTAP19-7Q3SYF9 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC8.47□□□□□ -1.05
KRTAP19-7Q3SYF9 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
KRTAP19-7Q3SYF9 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC8.47□□□□□ -1.05
KRTAP19-7Q3SYF9 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
KRTAP19-7Q3SYF9 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
KRTAP19-7Q3SYF9 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
KRTAP19-7Q3SYF9 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC8.47□□□□□ -1.05
KRTAP19-7Q3SYF9 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.47□□□□□ -1.05
KRTAP19-7Q3SYF9 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
KRTAP19-7Q3SYF9 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
KRTAP19-7Q3SYF9 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
KRTAP19-7Q3SYF9 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
KRTAP19-7Q3SYF9 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
KRTAP19-7Q3SYF9 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
KRTAP19-7Q3SYF9 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
KRTAP19-7Q3SYF9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
KRTAP19-7Q3SYF9 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
KRTAP19-7Q3SYF9 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC8.46□□□□□ -1.05
KRTAP19-7Q3SYF9 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
KRTAP19-7Q3SYF9 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
KRTAP19-7Q3SYF9 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
KRTAP19-7Q3SYF9 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.46□□□□□ -1.06
KRTAP19-7Q3SYF9 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
KRTAP19-7Q3SYF9 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC8.46□□□□□ -1.06
KRTAP19-7Q3SYF9 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC8.46□□□□□ -1.06
KRTAP19-7Q3SYF9 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
KRTAP19-7Q3SYF9 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
KRTAP19-7Q3SYF9 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC8.46□□□□□ -1.06
KRTAP19-7Q3SYF9 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.06
KRTAP19-7Q3SYF9 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
KRTAP19-7Q3SYF9 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC8.46□□□□□ -1.06
KRTAP19-7Q3SYF9 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.46□□□□□ -1.06
KRTAP19-7Q3SYF9 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC8.46□□□□□ -1.06
KRTAP19-7Q3SYF9 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.46□□□□□ -1.06
KRTAP19-7Q3SYF9 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP19-7Q3SYF9 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP19-7Q3SYF9 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP19-7Q3SYF9 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP19-7Q3SYF9 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP19-7Q3SYF9 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP19-7Q3SYF9 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP19-7Q3SYF9 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP19-7Q3SYF9 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP19-7Q3SYF9 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP19-7Q3SYF9 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP19-7Q3SYF9 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP19-7Q3SYF9 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP19-7Q3SYF9 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP19-7Q3SYF9 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP19-7Q3SYF9 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP19-7Q3SYF9 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP19-7Q3SYF9 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP19-7Q3SYF9 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP19-7Q3SYF9 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP19-7Q3SYF9 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP19-7Q3SYF9 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP19-7Q3SYF9 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP19-7Q3SYF9 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP19-7Q3SYF9 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
KRTAP19-7Q3SYF9 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
KRTAP19-7Q3SYF9 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
KRTAP19-7Q3SYF9 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
KRTAP19-7Q3SYF9 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
KRTAP19-7Q3SYF9 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
KRTAP19-7Q3SYF9 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms