Protein–RNA interactions for Protein: Q29983

MICA, MHC class I polypeptide-related sequence A, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MICAQ29983 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MICAQ29983 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MICAQ29983 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
MICAQ29983 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MICAQ29983 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MICAQ29983 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
MICAQ29983 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MICAQ29983 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MICAQ29983 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MICAQ29983 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MICAQ29983 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MICAQ29983 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MICAQ29983 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MICAQ29983 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
MICAQ29983 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MICAQ29983 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
MICAQ29983 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MICAQ29983 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MICAQ29983 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MICAQ29983 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MICAQ29983 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MICAQ29983 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MICAQ29983 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MICAQ29983 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MICAQ29983 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MICAQ29983 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MICAQ29983 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MICAQ29983 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MICAQ29983 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
MICAQ29983 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
MICAQ29983 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
MICAQ29983 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
MICAQ29983 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
MICAQ29983 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
MICAQ29983 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
MICAQ29983 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
MICAQ29983 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
MICAQ29983 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
MICAQ29983 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
MICAQ29983 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
MICAQ29983 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MICAQ29983 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
MICAQ29983 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MICAQ29983 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
MICAQ29983 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
MICAQ29983 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
MICAQ29983 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
MICAQ29983 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MICAQ29983 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MICAQ29983 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MICAQ29983 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MICAQ29983 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MICAQ29983 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MICAQ29983 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MICAQ29983 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MICAQ29983 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
MICAQ29983 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MICAQ29983 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MICAQ29983 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MICAQ29983 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
MICAQ29983 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MICAQ29983 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MICAQ29983 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MICAQ29983 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MICAQ29983 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MICAQ29983 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
MICAQ29983 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MICAQ29983 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
MICAQ29983 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
MICAQ29983 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
MICAQ29983 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
MICAQ29983 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MICAQ29983 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
MICAQ29983 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MICAQ29983 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MICAQ29983 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MICAQ29983 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MICAQ29983 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MICAQ29983 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MICAQ29983 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MICAQ29983 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
MICAQ29983 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MICAQ29983 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
MICAQ29983 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
MICAQ29983 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MICAQ29983 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
MICAQ29983 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MICAQ29983 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
MICAQ29983 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MICAQ29983 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MICAQ29983 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MICAQ29983 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MICAQ29983 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MICAQ29983 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MICAQ29983 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MICAQ29983 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
MICAQ29983 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MICAQ29983 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MICAQ29983 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
MICAQ29983 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.7 ms