Protein–RNA interactions for Protein: Q16394

EXT1, Exostosin-1, humanhuman

Predictions only

Length 746 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXT1Q16394 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EXT1Q16394 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
EXT1Q16394 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EXT1Q16394 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EXT1Q16394 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EXT1Q16394 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EXT1Q16394 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EXT1Q16394 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EXT1Q16394 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EXT1Q16394 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EXT1Q16394 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EXT1Q16394 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EXT1Q16394 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EXT1Q16394 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
EXT1Q16394 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EXT1Q16394 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EXT1Q16394 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EXT1Q16394 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EXT1Q16394 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EXT1Q16394 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EXT1Q16394 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EXT1Q16394 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
EXT1Q16394 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EXT1Q16394 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EXT1Q16394 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EXT1Q16394 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
EXT1Q16394 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EXT1Q16394 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EXT1Q16394 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EXT1Q16394 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EXT1Q16394 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EXT1Q16394 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EXT1Q16394 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EXT1Q16394 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EXT1Q16394 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EXT1Q16394 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EXT1Q16394 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EXT1Q16394 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EXT1Q16394 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EXT1Q16394 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EXT1Q16394 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EXT1Q16394 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EXT1Q16394 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
EXT1Q16394 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EXT1Q16394 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EXT1Q16394 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
EXT1Q16394 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EXT1Q16394 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
EXT1Q16394 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EXT1Q16394 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EXT1Q16394 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EXT1Q16394 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EXT1Q16394 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
EXT1Q16394 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EXT1Q16394 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
EXT1Q16394 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
EXT1Q16394 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
EXT1Q16394 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EXT1Q16394 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EXT1Q16394 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EXT1Q16394 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
EXT1Q16394 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EXT1Q16394 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EXT1Q16394 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EXT1Q16394 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
EXT1Q16394 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
EXT1Q16394 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
EXT1Q16394 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EXT1Q16394 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EXT1Q16394 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EXT1Q16394 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EXT1Q16394 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
EXT1Q16394 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
EXT1Q16394 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EXT1Q16394 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
EXT1Q16394 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
EXT1Q16394 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
EXT1Q16394 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
EXT1Q16394 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
EXT1Q16394 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
EXT1Q16394 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
EXT1Q16394 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
EXT1Q16394 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EXT1Q16394 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
EXT1Q16394 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EXT1Q16394 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EXT1Q16394 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
EXT1Q16394 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EXT1Q16394 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
EXT1Q16394 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
EXT1Q16394 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
EXT1Q16394 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EXT1Q16394 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EXT1Q16394 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EXT1Q16394 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EXT1Q16394 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EXT1Q16394 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EXT1Q16394 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EXT1Q16394 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
EXT1Q16394 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms