Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZIC1Q15915 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZIC1Q15915 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ZIC1Q15915 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZIC1Q15915 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZIC1Q15915 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZIC1Q15915 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZIC1Q15915 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZIC1Q15915 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZIC1Q15915 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZIC1Q15915 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZIC1Q15915 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZIC1Q15915 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZIC1Q15915 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZIC1Q15915 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ZIC1Q15915 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZIC1Q15915 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZIC1Q15915 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZIC1Q15915 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZIC1Q15915 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZIC1Q15915 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZIC1Q15915 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZIC1Q15915 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZIC1Q15915 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZIC1Q15915 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZIC1Q15915 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ZIC1Q15915 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZIC1Q15915 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZIC1Q15915 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZIC1Q15915 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZIC1Q15915 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZIC1Q15915 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZIC1Q15915 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZIC1Q15915 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZIC1Q15915 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZIC1Q15915 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZIC1Q15915 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZIC1Q15915 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZIC1Q15915 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZIC1Q15915 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZIC1Q15915 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZIC1Q15915 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZIC1Q15915 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZIC1Q15915 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZIC1Q15915 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZIC1Q15915 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZIC1Q15915 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZIC1Q15915 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZIC1Q15915 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZIC1Q15915 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZIC1Q15915 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZIC1Q15915 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ZIC1Q15915 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ZIC1Q15915 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ZIC1Q15915 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZIC1Q15915 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZIC1Q15915 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZIC1Q15915 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZIC1Q15915 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZIC1Q15915 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZIC1Q15915 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZIC1Q15915 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZIC1Q15915 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ZIC1Q15915 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZIC1Q15915 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZIC1Q15915 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZIC1Q15915 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZIC1Q15915 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZIC1Q15915 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZIC1Q15915 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZIC1Q15915 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZIC1Q15915 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZIC1Q15915 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZIC1Q15915 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZIC1Q15915 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZIC1Q15915 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZIC1Q15915 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZIC1Q15915 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZIC1Q15915 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZIC1Q15915 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZIC1Q15915 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZIC1Q15915 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZIC1Q15915 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZIC1Q15915 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZIC1Q15915 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZIC1Q15915 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZIC1Q15915 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZIC1Q15915 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ZIC1Q15915 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZIC1Q15915 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZIC1Q15915 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZIC1Q15915 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZIC1Q15915 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZIC1Q15915 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZIC1Q15915 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZIC1Q15915 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZIC1Q15915 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZIC1Q15915 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZIC1Q15915 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZIC1Q15915 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms