Protein–RNA interactions for Protein: Q15365

PCBP1, Poly(rC)-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1Q15365 SEPT9-230ENST00000590586 572 ntTSL 422.67■■□□□ 1.222e-6■■■■■ 32.7
PCBP1Q15365 SEPT9-216ENST00000586812 466 ntTSL 222.67■■□□□ 1.222e-6■■■■■ 32.7
PCBP1Q15365 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.22e-6■■■■■ 32.7
PCBP1Q15365 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.172e-6■■■■■ 32.7
PCBP1Q15365 TSC22D4-206ENST00000496728 837 ntTSL 322.36■■□□□ 1.176e-7■■■■■ 32.7
PCBP1Q15365 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.092e-6■■■■■ 32.7
PCBP1Q15365 SEPT9-223ENST00000589140 552 ntTSL 421.86■■□□□ 1.092e-6■■■■■ 32.7
PCBP1Q15365 TCIRG1-206ENST00000527530 529 ntTSL 321.7■■□□□ 1.065e-23■■■■■ 32.7
PCBP1Q15365 INTS11-220ENST00000493534 896 ntTSL 321.69■■□□□ 1.062e-6■■■■■ 32.7
PCBP1Q15365 LIMS2-214ENST00000476932 2269 ntTSL 221.66■■□□□ 1.062e-6■■■■■ 32.7
PCBP1Q15365 TMEM8B-205ENST00000464519 681 ntTSL 321.64■■□□□ 1.051e-6■■■■■ 32.7
PCBP1Q15365 TRAF4-216ENST00000586813 789 ntTSL 321.57■■□□□ 1.044e-7■■■■■ 32.7
PCBP1Q15365 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.042e-6■■■■■ 32.7
PCBP1Q15365 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.032e-6■■■■■ 32.7
PCBP1Q15365 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.031e-6■■■■■ 32.7
PCBP1Q15365 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.984e-7■■■■■ 32.7
PCBP1Q15365 PDLIM7-204ENST00000393546 671 ntTSL 321.04■□□□□ 0.964e-10■■■■■ 32.7
PCBP1Q15365 INTS11-224ENST00000498476 554 ntTSL 420.97■□□□□ 0.952e-6■■■■■ 32.7
PCBP1Q15365 INTS11-239ENST00000531019 549 ntTSL 420.97■□□□□ 0.952e-6■■■■■ 32.7
PCBP1Q15365 ZYX-205ENST00000446634 926 ntTSL 520.95■□□□□ 0.942e-8■■■■■ 32.7
PCBP1Q15365 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.922e-6■■■■■ 32.7
PCBP1Q15365 INTS11-219ENST00000490853 704 ntTSL 320.71■□□□□ 0.912e-6■■■■■ 32.7
PCBP1Q15365 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.92e-6■■■■■ 32.7
PCBP1Q15365 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.92e-6■■■■■ 32.7
PCBP1Q15365 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.892e-6■■■■■ 32.7
PCBP1Q15365 INTS11-215ENST00000470679 584 ntTSL 520.57■□□□□ 0.882e-6■■■■■ 32.7
PCBP1Q15365 TMEM8B-207ENST00000473947 999 ntTSL 520.48■□□□□ 0.871e-6■■■■■ 32.7
PCBP1Q15365 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.842e-6■■■■■ 32.7
PCBP1Q15365 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.842e-6■■■■■ 32.7
PCBP1Q15365 ZFAND2A-202ENST00000397083 852 ntTSL 1 (best)20.32■□□□□ 0.842e-6■■■■■ 32.7
PCBP1Q15365 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.842e-6■■■■■ 32.7
PCBP1Q15365 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.841e-6■■■■■ 32.7
PCBP1Q15365 SEZ6L2-206ENST00000563118 909 ntTSL 520.27■□□□□ 0.842e-6■■■■■ 32.7
PCBP1Q15365 LIMS2-215ENST00000484252 2099 ntTSL 220.26■□□□□ 0.832e-6■■■■■ 32.7
PCBP1Q15365 TMEM59L-203ENST00000594859 1557 ntTSL 1 (best)20.23■□□□□ 0.832e-6■■■■■ 32.7
PCBP1Q15365 PDLIM7-209ENST00000503346 669 ntTSL 220.21■□□□□ 0.834e-10■■■■■ 32.7
PCBP1Q15365 AP2A2-212ENST00000528195 562 ntTSL 320.17■□□□□ 0.822e-6■■■■■ 32.7
PCBP1Q15365 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.82e-6■■■■■ 32.7
PCBP1Q15365 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.781e-6■■■■■ 32.7
PCBP1Q15365 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.771e-9■■■■■ 32.7
PCBP1Q15365 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.772e-6■■■■■ 32.7
PCBP1Q15365 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.771e-7■■■■■ 32.7
PCBP1Q15365 LIMS2-212ENST00000466410 2592 ntTSL 219.79■□□□□ 0.762e-6■■■■■ 32.7
PCBP1Q15365 TSC22D4-205ENST00000493217 2060 ntTSL 1 (best)19.67■□□□□ 0.748e-23■■■■■ 32.7
PCBP1Q15365 ACBD4-205ENST00000585553 2241 ntTSL 219.67■□□□□ 0.742e-6■■■■■ 32.7
PCBP1Q15365 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.749e-7■■■■■ 32.7
PCBP1Q15365 PDLIM7-208ENST00000493815 1686 ntTSL 1 (best)19.65■□□□□ 0.749e-7■■■■■ 32.7
PCBP1Q15365 ARHGAP33-208ENST00000588248 2004 ntTSL 519.57■□□□□ 0.722e-6■■■■■ 32.7
PCBP1Q15365 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.712e-6■■■■■ 32.7
PCBP1Q15365 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.79e-7■■■■■ 32.7
PCBP1Q15365 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.681e-8■■■■■ 32.7
PCBP1Q15365 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.672e-6■■■■■ 32.7
PCBP1Q15365 SEPT9-241ENST00000591934 553 ntTSL 419.15■□□□□ 0.662e-6■■■■■ 32.7
PCBP1Q15365 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.642e-6■■■■■ 32.7
PCBP1Q15365 SLC7A1-202ENST00000450494 547 ntTSL 219.04■□□□□ 0.642e-6■■■■■ 32.7
PCBP1Q15365 INTS11-221ENST00000496353 2428 ntTSL 218.98■□□□□ 0.632e-6■■■■■ 32.7
PCBP1Q15365 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.591e-8■■■■■ 32.7
PCBP1Q15365 KANSL1-225ENST00000639356 1717 ntTSL 518.73■□□□□ 0.592e-6■■■■■ 32.7
PCBP1Q15365 PDLIM7-207ENST00000486828 1904 ntTSL 1 (best)18.7■□□□□ 0.589e-7■■■■■ 32.7
PCBP1Q15365 LIMS2-211ENST00000426981 1409 ntTSL 318.67■□□□□ 0.582e-6■■■■■ 32.7
PCBP1Q15365 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.582e-6■■■■■ 32.7
PCBP1Q15365 C2orf82-206ENST00000467665 2782 ntTSL 1 (best)18.63■□□□□ 0.572e-6■■■■■ 32.7
PCBP1Q15365 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.562e-6■■■■■ 32.7
PCBP1Q15365 PDLIM7-215ENST00000506161 759 ntTSL 318.5■□□□□ 0.554e-10■■■■■ 32.7
PCBP1Q15365 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.553e-7■■■■■ 32.7
PCBP1Q15365 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.512e-6■■■■■ 32.7
PCBP1Q15365 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.52e-6■■■■■ 32.7
PCBP1Q15365 GPX3-205ENST00000520597 632 ntTSL 218.08■□□□□ 0.482e-6■■■■■ 32.7
PCBP1Q15365 SEPT9-231ENST00000590595 569 ntTSL 318.03■□□□□ 0.482e-6■■■■■ 32.7
PCBP1Q15365 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.452e-6■■■■■ 32.7
PCBP1Q15365 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.452e-6■■■■■ 32.7
PCBP1Q15365 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.444e-7■■■■■ 32.7
PCBP1Q15365 PDLIM7-213ENST00000505074 931 ntTSL 317.72■□□□□ 0.431e-6■■■■■ 32.7
PCBP1Q15365 PDLIM7-210ENST00000503827 451 ntTSL 517.65■□□□□ 0.424e-10■■■■■ 32.7
PCBP1Q15365 KANSL1-209ENST00000574655 1681 ntTSL 517.63■□□□□ 0.412e-6■■■■■ 32.7
PCBP1Q15365 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.394e-7■■■■■ 32.7
PCBP1Q15365 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.372e-6■■■■■ 32.7
PCBP1Q15365 LIMS2-216ENST00000494613 1137 ntTSL 217.33■□□□□ 0.362e-6■■■■■ 32.7
PCBP1Q15365 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.342e-6■■■■■ 32.7
PCBP1Q15365 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.332e-6■■■■■ 32.7
PCBP1Q15365 KANSL1-222ENST00000639099 1724 ntTSL 517.13■□□□□ 0.332e-6■■■■■ 32.7
PCBP1Q15365 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.322e-6■■■■■ 32.7
PCBP1Q15365 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.32e-6■■■■■ 32.7
PCBP1Q15365 ZSWIM8-205ENST00000433366 5773 ntTSL 516.83■□□□□ 0.292e-6■■■■■ 32.7
PCBP1Q15365 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.282e-6■■■■■ 32.7
PCBP1Q15365 FNBP1-207ENST00000478129 730 ntTSL 316.67■□□□□ 0.262e-6■■■■■ 32.7
PCBP1Q15365 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.262e-6■■■■■ 32.7
PCBP1Q15365 PNPLA2-206ENST00000534561 388 ntTSL 216.53■□□□□ 0.242e-6■■■■■ 32.7
PCBP1Q15365 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.232e-6■■■■■ 32.7
PCBP1Q15365 INTS11-226ENST00000525285 579 ntTSL 416.46■□□□□ 0.232e-6■■■■■ 32.7
PCBP1Q15365 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.211e-9■■■■■ 32.7
PCBP1Q15365 TRAF4-212ENST00000498540 748 ntTSL 316.36■□□□□ 0.214e-7■■■■■ 32.7
PCBP1Q15365 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.142e-6■■■■■ 32.7
PCBP1Q15365 ACBD4-210ENST00000589752 804 ntTSL 315.85■□□□□ 0.132e-6■■■■■ 32.7
PCBP1Q15365 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.122e-6■■■■■ 32.7
PCBP1Q15365 LIMS2-213ENST00000469300 4807 ntTSL 215.77■□□□□ 0.122e-6■■■■■ 32.7
PCBP1Q15365 TMEM8B-206ENST00000472010 964 ntTSL 315.77■□□□□ 0.121e-6■■■■■ 32.7
PCBP1Q15365 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.12e-6■■■■■ 32.7
PCBP1Q15365 OTUD7B-201ENST00000417191 1425 ntTSL 1 (best)15.59■□□□□ 0.092e-6■■■■■ 32.7
PCBP1Q15365 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.082e-6■■■■■ 32.7
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