Protein–RNA interactions for Protein: Q13296

SCGB2A2, Mammaglobin-A, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB2A2Q13296 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SCGB2A2Q13296 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SCGB2A2Q13296 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SCGB2A2Q13296 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCGB2A2Q13296 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCGB2A2Q13296 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCGB2A2Q13296 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCGB2A2Q13296 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCGB2A2Q13296 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCGB2A2Q13296 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCGB2A2Q13296 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCGB2A2Q13296 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCGB2A2Q13296 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCGB2A2Q13296 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCGB2A2Q13296 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCGB2A2Q13296 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCGB2A2Q13296 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SCGB2A2Q13296 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCGB2A2Q13296 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCGB2A2Q13296 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCGB2A2Q13296 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCGB2A2Q13296 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCGB2A2Q13296 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCGB2A2Q13296 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCGB2A2Q13296 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SCGB2A2Q13296 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SCGB2A2Q13296 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SCGB2A2Q13296 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SCGB2A2Q13296 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SCGB2A2Q13296 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SCGB2A2Q13296 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SCGB2A2Q13296 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SCGB2A2Q13296 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SCGB2A2Q13296 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SCGB2A2Q13296 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SCGB2A2Q13296 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SCGB2A2Q13296 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SCGB2A2Q13296 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SCGB2A2Q13296 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SCGB2A2Q13296 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCGB2A2Q13296 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCGB2A2Q13296 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCGB2A2Q13296 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
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SCGB2A2Q13296 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCGB2A2Q13296 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCGB2A2Q13296 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCGB2A2Q13296 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
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SCGB2A2Q13296 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCGB2A2Q13296 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCGB2A2Q13296 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
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SCGB2A2Q13296 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCGB2A2Q13296 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
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SCGB2A2Q13296 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SCGB2A2Q13296 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SCGB2A2Q13296 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SCGB2A2Q13296 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
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SCGB2A2Q13296 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SCGB2A2Q13296 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
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SCGB2A2Q13296 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCGB2A2Q13296 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCGB2A2Q13296 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCGB2A2Q13296 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCGB2A2Q13296 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCGB2A2Q13296 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCGB2A2Q13296 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCGB2A2Q13296 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCGB2A2Q13296 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SCGB2A2Q13296 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCGB2A2Q13296 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCGB2A2Q13296 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCGB2A2Q13296 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SCGB2A2Q13296 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SCGB2A2Q13296 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SCGB2A2Q13296 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SCGB2A2Q13296 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SCGB2A2Q13296 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SCGB2A2Q13296 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SCGB2A2Q13296 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SCGB2A2Q13296 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SCGB2A2Q13296 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SCGB2A2Q13296 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SCGB2A2Q13296 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SCGB2A2Q13296 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SCGB2A2Q13296 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
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