Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MKRN3Q13064 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MKRN3Q13064 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MKRN3Q13064 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MKRN3Q13064 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MKRN3Q13064 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MKRN3Q13064 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MKRN3Q13064 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
MKRN3Q13064 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MKRN3Q13064 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MKRN3Q13064 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MKRN3Q13064 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MKRN3Q13064 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MKRN3Q13064 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
MKRN3Q13064 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MKRN3Q13064 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MKRN3Q13064 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MKRN3Q13064 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MKRN3Q13064 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MKRN3Q13064 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MKRN3Q13064 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MKRN3Q13064 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MKRN3Q13064 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MKRN3Q13064 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MKRN3Q13064 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MKRN3Q13064 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MKRN3Q13064 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MKRN3Q13064 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
MKRN3Q13064 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MKRN3Q13064 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MKRN3Q13064 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MKRN3Q13064 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MKRN3Q13064 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MKRN3Q13064 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MKRN3Q13064 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MKRN3Q13064 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MKRN3Q13064 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MKRN3Q13064 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MKRN3Q13064 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MKRN3Q13064 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MKRN3Q13064 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MKRN3Q13064 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MKRN3Q13064 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MKRN3Q13064 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MKRN3Q13064 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MKRN3Q13064 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MKRN3Q13064 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MKRN3Q13064 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MKRN3Q13064 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MKRN3Q13064 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MKRN3Q13064 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MKRN3Q13064 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MKRN3Q13064 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MKRN3Q13064 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MKRN3Q13064 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MKRN3Q13064 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MKRN3Q13064 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MKRN3Q13064 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MKRN3Q13064 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MKRN3Q13064 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MKRN3Q13064 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MKRN3Q13064 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MKRN3Q13064 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MKRN3Q13064 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MKRN3Q13064 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MKRN3Q13064 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MKRN3Q13064 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MKRN3Q13064 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MKRN3Q13064 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MKRN3Q13064 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
MKRN3Q13064 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
MKRN3Q13064 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
MKRN3Q13064 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
MKRN3Q13064 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MKRN3Q13064 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MKRN3Q13064 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MKRN3Q13064 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MKRN3Q13064 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MKRN3Q13064 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MKRN3Q13064 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
MKRN3Q13064 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MKRN3Q13064 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MKRN3Q13064 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MKRN3Q13064 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MKRN3Q13064 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MKRN3Q13064 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MKRN3Q13064 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MKRN3Q13064 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
MKRN3Q13064 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MKRN3Q13064 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MKRN3Q13064 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MKRN3Q13064 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MKRN3Q13064 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MKRN3Q13064 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MKRN3Q13064 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MKRN3Q13064 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MKRN3Q13064 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MKRN3Q13064 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MKRN3Q13064 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MKRN3Q13064 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
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