Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NPRL3Q12980 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NPRL3Q12980 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NPRL3Q12980 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NPRL3Q12980 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NPRL3Q12980 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NPRL3Q12980 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NPRL3Q12980 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NPRL3Q12980 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NPRL3Q12980 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
NPRL3Q12980 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NPRL3Q12980 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NPRL3Q12980 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NPRL3Q12980 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
NPRL3Q12980 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
NPRL3Q12980 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NPRL3Q12980 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NPRL3Q12980 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
NPRL3Q12980 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NPRL3Q12980 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
NPRL3Q12980 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
NPRL3Q12980 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NPRL3Q12980 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NPRL3Q12980 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NPRL3Q12980 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NPRL3Q12980 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NPRL3Q12980 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NPRL3Q12980 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NPRL3Q12980 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
NPRL3Q12980 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NPRL3Q12980 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
NPRL3Q12980 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NPRL3Q12980 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
NPRL3Q12980 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NPRL3Q12980 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
NPRL3Q12980 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21■□□□□ 0.95
NPRL3Q12980 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
NPRL3Q12980 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NPRL3Q12980 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
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NPRL3Q12980 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
NPRL3Q12980 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NPRL3Q12980 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NPRL3Q12980 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
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NPRL3Q12980 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NPRL3Q12980 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
NPRL3Q12980 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
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NPRL3Q12980 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NPRL3Q12980 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NPRL3Q12980 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
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NPRL3Q12980 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
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NPRL3Q12980 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
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NPRL3Q12980 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NPRL3Q12980 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
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NPRL3Q12980 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
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NPRL3Q12980 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NPRL3Q12980 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NPRL3Q12980 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NPRL3Q12980 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NPRL3Q12980 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NPRL3Q12980 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NPRL3Q12980 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
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NPRL3Q12980 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NPRL3Q12980 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NPRL3Q12980 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
NPRL3Q12980 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NPRL3Q12980 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NPRL3Q12980 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NPRL3Q12980 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NPRL3Q12980 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
NPRL3Q12980 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NPRL3Q12980 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NPRL3Q12980 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NPRL3Q12980 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NPRL3Q12980 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NPRL3Q12980 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NPRL3Q12980 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NPRL3Q12980 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NPRL3Q12980 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
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