Protein–RNA interactions for Protein: Q12965

MYO1E, Unconventional myosin-Ie, humanhuman

Predictions only

Length 1,108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYO1EQ12965 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MYO1EQ12965 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
MYO1EQ12965 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MYO1EQ12965 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MYO1EQ12965 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MYO1EQ12965 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MYO1EQ12965 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MYO1EQ12965 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MYO1EQ12965 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MYO1EQ12965 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MYO1EQ12965 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MYO1EQ12965 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MYO1EQ12965 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MYO1EQ12965 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
MYO1EQ12965 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MYO1EQ12965 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MYO1EQ12965 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MYO1EQ12965 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MYO1EQ12965 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MYO1EQ12965 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MYO1EQ12965 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MYO1EQ12965 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MYO1EQ12965 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MYO1EQ12965 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MYO1EQ12965 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MYO1EQ12965 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MYO1EQ12965 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MYO1EQ12965 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
MYO1EQ12965 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MYO1EQ12965 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MYO1EQ12965 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MYO1EQ12965 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MYO1EQ12965 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MYO1EQ12965 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MYO1EQ12965 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MYO1EQ12965 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MYO1EQ12965 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MYO1EQ12965 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MYO1EQ12965 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MYO1EQ12965 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MYO1EQ12965 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MYO1EQ12965 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MYO1EQ12965 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MYO1EQ12965 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MYO1EQ12965 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MYO1EQ12965 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MYO1EQ12965 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MYO1EQ12965 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MYO1EQ12965 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MYO1EQ12965 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MYO1EQ12965 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MYO1EQ12965 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MYO1EQ12965 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
MYO1EQ12965 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MYO1EQ12965 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MYO1EQ12965 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
MYO1EQ12965 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MYO1EQ12965 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MYO1EQ12965 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MYO1EQ12965 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MYO1EQ12965 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MYO1EQ12965 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MYO1EQ12965 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MYO1EQ12965 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MYO1EQ12965 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MYO1EQ12965 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MYO1EQ12965 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MYO1EQ12965 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MYO1EQ12965 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MYO1EQ12965 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MYO1EQ12965 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MYO1EQ12965 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MYO1EQ12965 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MYO1EQ12965 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MYO1EQ12965 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MYO1EQ12965 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MYO1EQ12965 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MYO1EQ12965 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MYO1EQ12965 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MYO1EQ12965 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MYO1EQ12965 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MYO1EQ12965 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MYO1EQ12965 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MYO1EQ12965 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MYO1EQ12965 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MYO1EQ12965 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MYO1EQ12965 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MYO1EQ12965 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MYO1EQ12965 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MYO1EQ12965 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MYO1EQ12965 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MYO1EQ12965 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MYO1EQ12965 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MYO1EQ12965 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MYO1EQ12965 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MYO1EQ12965 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MYO1EQ12965 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MYO1EQ12965 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MYO1EQ12965 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MYO1EQ12965 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.7 ms