Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CLTCQ00610 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
CLTCQ00610 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC33.77■■■■□ 3
CLTCQ00610 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
CLTCQ00610 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
CLTCQ00610 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC33.77■■■■□ 3
CLTCQ00610 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
CLTCQ00610 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
CLTCQ00610 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
CLTCQ00610 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
CLTCQ00610 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC33.77■■■■□ 3
CLTCQ00610 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC33.76■■■■□ 3
CLTCQ00610 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
CLTCQ00610 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
CLTCQ00610 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
CLTCQ00610 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
CLTCQ00610 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
CLTCQ00610 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
CLTCQ00610 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
CLTCQ00610 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
CLTCQ00610 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
CLTCQ00610 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
CLTCQ00610 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
CLTCQ00610 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
CLTCQ00610 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
CLTCQ00610 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
CLTCQ00610 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
CLTCQ00610 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
CLTCQ00610 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
CLTCQ00610 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
CLTCQ00610 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
CLTCQ00610 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
CLTCQ00610 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
CLTCQ00610 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
CLTCQ00610 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
CLTCQ00610 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
CLTCQ00610 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
CLTCQ00610 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC33.73■■■□□ 2.99
CLTCQ00610 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
CLTCQ00610 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.73■■■□□ 2.99
CLTCQ00610 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
CLTCQ00610 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
CLTCQ00610 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
CLTCQ00610 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
CLTCQ00610 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CLTCQ00610 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC33.72■■■□□ 2.99
CLTCQ00610 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC33.72■■■□□ 2.99
CLTCQ00610 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
CLTCQ00610 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
CLTCQ00610 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CLTCQ00610 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
CLTCQ00610 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
CLTCQ00610 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
CLTCQ00610 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
CLTCQ00610 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
CLTCQ00610 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
CLTCQ00610 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
CLTCQ00610 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.98
CLTCQ00610 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.98
CLTCQ00610 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.98
CLTCQ00610 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
CLTCQ00610 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
CLTCQ00610 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
CLTCQ00610 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
CLTCQ00610 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
CLTCQ00610 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
CLTCQ00610 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
CLTCQ00610 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
CLTCQ00610 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC33.68■■■□□ 2.98
CLTCQ00610 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
CLTCQ00610 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC33.68■■■□□ 2.98
CLTCQ00610 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
CLTCQ00610 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
CLTCQ00610 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
CLTCQ00610 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
CLTCQ00610 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
CLTCQ00610 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
CLTCQ00610 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
CLTCQ00610 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
CLTCQ00610 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
CLTCQ00610 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
CLTCQ00610 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC33.66■■■□□ 2.98
CLTCQ00610 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
CLTCQ00610 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
CLTCQ00610 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
CLTCQ00610 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
CLTCQ00610 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
CLTCQ00610 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
CLTCQ00610 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
CLTCQ00610 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
CLTCQ00610 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
CLTCQ00610 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
CLTCQ00610 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
CLTCQ00610 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
CLTCQ00610 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
CLTCQ00610 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
CLTCQ00610 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
CLTCQ00610 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
CLTCQ00610 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
CLTCQ00610 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 507.6 ms