Protein–RNA interactions for Protein: P78364

PHC1, Polyhomeotic-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHC1P78364 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PHC1P78364 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PHC1P78364 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PHC1P78364 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PHC1P78364 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PHC1P78364 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PHC1P78364 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PHC1P78364 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PHC1P78364 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PHC1P78364 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PHC1P78364 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PHC1P78364 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PHC1P78364 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PHC1P78364 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PHC1P78364 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PHC1P78364 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PHC1P78364 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PHC1P78364 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PHC1P78364 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PHC1P78364 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PHC1P78364 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PHC1P78364 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PHC1P78364 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PHC1P78364 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PHC1P78364 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PHC1P78364 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PHC1P78364 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PHC1P78364 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PHC1P78364 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PHC1P78364 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PHC1P78364 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PHC1P78364 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PHC1P78364 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PHC1P78364 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PHC1P78364 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PHC1P78364 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PHC1P78364 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PHC1P78364 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
PHC1P78364 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PHC1P78364 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PHC1P78364 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PHC1P78364 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PHC1P78364 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PHC1P78364 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PHC1P78364 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PHC1P78364 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PHC1P78364 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PHC1P78364 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PHC1P78364 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PHC1P78364 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PHC1P78364 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PHC1P78364 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PHC1P78364 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PHC1P78364 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PHC1P78364 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PHC1P78364 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PHC1P78364 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PHC1P78364 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PHC1P78364 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PHC1P78364 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PHC1P78364 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PHC1P78364 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PHC1P78364 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PHC1P78364 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PHC1P78364 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PHC1P78364 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PHC1P78364 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PHC1P78364 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PHC1P78364 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PHC1P78364 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PHC1P78364 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PHC1P78364 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PHC1P78364 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PHC1P78364 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PHC1P78364 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PHC1P78364 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PHC1P78364 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PHC1P78364 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PHC1P78364 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PHC1P78364 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PHC1P78364 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PHC1P78364 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PHC1P78364 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PHC1P78364 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PHC1P78364 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PHC1P78364 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PHC1P78364 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PHC1P78364 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PHC1P78364 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PHC1P78364 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PHC1P78364 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PHC1P78364 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PHC1P78364 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PHC1P78364 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PHC1P78364 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PHC1P78364 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PHC1P78364 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PHC1P78364 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PHC1P78364 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PHC1P78364 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms