Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RAD23AP54725 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RAD23AP54725 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RAD23AP54725 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RAD23AP54725 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RAD23AP54725 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAD23AP54725 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAD23AP54725 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAD23AP54725 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAD23AP54725 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAD23AP54725 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAD23AP54725 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAD23AP54725 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAD23AP54725 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAD23AP54725 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAD23AP54725 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAD23AP54725 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAD23AP54725 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAD23AP54725 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAD23AP54725 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAD23AP54725 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAD23AP54725 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAD23AP54725 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAD23AP54725 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAD23AP54725 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAD23AP54725 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAD23AP54725 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAD23AP54725 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAD23AP54725 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAD23AP54725 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAD23AP54725 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAD23AP54725 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAD23AP54725 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAD23AP54725 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAD23AP54725 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
RAD23AP54725 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
RAD23AP54725 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAD23AP54725 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAD23AP54725 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAD23AP54725 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAD23AP54725 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAD23AP54725 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAD23AP54725 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
RAD23AP54725 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAD23AP54725 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAD23AP54725 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAD23AP54725 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAD23AP54725 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAD23AP54725 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAD23AP54725 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAD23AP54725 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAD23AP54725 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAD23AP54725 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAD23AP54725 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAD23AP54725 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAD23AP54725 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAD23AP54725 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAD23AP54725 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAD23AP54725 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAD23AP54725 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAD23AP54725 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAD23AP54725 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAD23AP54725 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAD23AP54725 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAD23AP54725 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RAD23AP54725 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RAD23AP54725 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RAD23AP54725 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RAD23AP54725 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RAD23AP54725 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RAD23AP54725 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RAD23AP54725 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
RAD23AP54725 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RAD23AP54725 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
RAD23AP54725 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RAD23AP54725 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
RAD23AP54725 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RAD23AP54725 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RAD23AP54725 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RAD23AP54725 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RAD23AP54725 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RAD23AP54725 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RAD23AP54725 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RAD23AP54725 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RAD23AP54725 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RAD23AP54725 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RAD23AP54725 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RAD23AP54725 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RAD23AP54725 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RAD23AP54725 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RAD23AP54725 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RAD23AP54725 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
RAD23AP54725 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RAD23AP54725 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAD23AP54725 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAD23AP54725 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAD23AP54725 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAD23AP54725 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAD23AP54725 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
RAD23AP54725 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms