Protein–RNA interactions for Protein: P48751

SLC4A3, Anion exchange protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A3P48751 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLC4A3P48751 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLC4A3P48751 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLC4A3P48751 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLC4A3P48751 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLC4A3P48751 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLC4A3P48751 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLC4A3P48751 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLC4A3P48751 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLC4A3P48751 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLC4A3P48751 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLC4A3P48751 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLC4A3P48751 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLC4A3P48751 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLC4A3P48751 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLC4A3P48751 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLC4A3P48751 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLC4A3P48751 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLC4A3P48751 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLC4A3P48751 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLC4A3P48751 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLC4A3P48751 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLC4A3P48751 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
SLC4A3P48751 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
SLC4A3P48751 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SLC4A3P48751 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SLC4A3P48751 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SLC4A3P48751 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SLC4A3P48751 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SLC4A3P48751 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SLC4A3P48751 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SLC4A3P48751 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SLC4A3P48751 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SLC4A3P48751 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
SLC4A3P48751 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SLC4A3P48751 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SLC4A3P48751 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SLC4A3P48751 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SLC4A3P48751 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLC4A3P48751 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLC4A3P48751 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLC4A3P48751 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLC4A3P48751 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLC4A3P48751 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SLC4A3P48751 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SLC4A3P48751 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SLC4A3P48751 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SLC4A3P48751 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SLC4A3P48751 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SLC4A3P48751 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC4A3P48751 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC4A3P48751 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC4A3P48751 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC4A3P48751 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC4A3P48751 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC4A3P48751 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC4A3P48751 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC4A3P48751 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC4A3P48751 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLC4A3P48751 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLC4A3P48751 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLC4A3P48751 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLC4A3P48751 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
SLC4A3P48751 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLC4A3P48751 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLC4A3P48751 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLC4A3P48751 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLC4A3P48751 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SLC4A3P48751 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SLC4A3P48751 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SLC4A3P48751 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
SLC4A3P48751 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SLC4A3P48751 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SLC4A3P48751 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SLC4A3P48751 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SLC4A3P48751 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SLC4A3P48751 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SLC4A3P48751 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLC4A3P48751 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLC4A3P48751 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLC4A3P48751 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLC4A3P48751 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLC4A3P48751 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLC4A3P48751 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLC4A3P48751 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLC4A3P48751 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLC4A3P48751 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLC4A3P48751 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLC4A3P48751 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLC4A3P48751 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
SLC4A3P48751 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLC4A3P48751 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLC4A3P48751 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLC4A3P48751 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLC4A3P48751 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLC4A3P48751 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLC4A3P48751 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLC4A3P48751 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLC4A3P48751 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLC4A3P48751 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms