Protein–RNA interactions for Protein: P42025

ACTR1B, Beta-centractin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR1BP42025 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACTR1BP42025 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACTR1BP42025 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACTR1BP42025 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACTR1BP42025 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACTR1BP42025 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACTR1BP42025 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACTR1BP42025 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACTR1BP42025 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACTR1BP42025 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACTR1BP42025 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACTR1BP42025 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACTR1BP42025 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACTR1BP42025 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACTR1BP42025 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACTR1BP42025 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACTR1BP42025 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACTR1BP42025 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACTR1BP42025 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACTR1BP42025 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ACTR1BP42025 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACTR1BP42025 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACTR1BP42025 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACTR1BP42025 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACTR1BP42025 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACTR1BP42025 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACTR1BP42025 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACTR1BP42025 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACTR1BP42025 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACTR1BP42025 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACTR1BP42025 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACTR1BP42025 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACTR1BP42025 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACTR1BP42025 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACTR1BP42025 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACTR1BP42025 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACTR1BP42025 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACTR1BP42025 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACTR1BP42025 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACTR1BP42025 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACTR1BP42025 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ACTR1BP42025 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACTR1BP42025 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACTR1BP42025 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACTR1BP42025 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACTR1BP42025 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACTR1BP42025 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACTR1BP42025 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACTR1BP42025 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACTR1BP42025 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACTR1BP42025 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACTR1BP42025 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACTR1BP42025 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACTR1BP42025 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACTR1BP42025 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACTR1BP42025 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ACTR1BP42025 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACTR1BP42025 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACTR1BP42025 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACTR1BP42025 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACTR1BP42025 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACTR1BP42025 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACTR1BP42025 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACTR1BP42025 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACTR1BP42025 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACTR1BP42025 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACTR1BP42025 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACTR1BP42025 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACTR1BP42025 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACTR1BP42025 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACTR1BP42025 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACTR1BP42025 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ACTR1BP42025 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACTR1BP42025 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACTR1BP42025 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACTR1BP42025 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACTR1BP42025 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACTR1BP42025 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACTR1BP42025 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ACTR1BP42025 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACTR1BP42025 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACTR1BP42025 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACTR1BP42025 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACTR1BP42025 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACTR1BP42025 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACTR1BP42025 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACTR1BP42025 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACTR1BP42025 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACTR1BP42025 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACTR1BP42025 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACTR1BP42025 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACTR1BP42025 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACTR1BP42025 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACTR1BP42025 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACTR1BP42025 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ACTR1BP42025 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ACTR1BP42025 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACTR1BP42025 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACTR1BP42025 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACTR1BP42025 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms