Protein–RNA interactions for Protein: P33151

CDH5, Cadherin-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH5P33151 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDH5P33151 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDH5P33151 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CDH5P33151 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDH5P33151 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CDH5P33151 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CDH5P33151 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CDH5P33151 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CDH5P33151 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDH5P33151 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDH5P33151 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDH5P33151 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDH5P33151 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDH5P33151 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDH5P33151 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDH5P33151 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDH5P33151 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CDH5P33151 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDH5P33151 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDH5P33151 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDH5P33151 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDH5P33151 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDH5P33151 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDH5P33151 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDH5P33151 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDH5P33151 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDH5P33151 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDH5P33151 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDH5P33151 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDH5P33151 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDH5P33151 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDH5P33151 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDH5P33151 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDH5P33151 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDH5P33151 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CDH5P33151 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDH5P33151 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDH5P33151 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDH5P33151 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CDH5P33151 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDH5P33151 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDH5P33151 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDH5P33151 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDH5P33151 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDH5P33151 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDH5P33151 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDH5P33151 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDH5P33151 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDH5P33151 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDH5P33151 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDH5P33151 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDH5P33151 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDH5P33151 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDH5P33151 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDH5P33151 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CDH5P33151 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CDH5P33151 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDH5P33151 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDH5P33151 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDH5P33151 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDH5P33151 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDH5P33151 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDH5P33151 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDH5P33151 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDH5P33151 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDH5P33151 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDH5P33151 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDH5P33151 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDH5P33151 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDH5P33151 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDH5P33151 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDH5P33151 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDH5P33151 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CDH5P33151 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDH5P33151 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDH5P33151 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDH5P33151 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CDH5P33151 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CDH5P33151 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDH5P33151 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDH5P33151 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDH5P33151 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CDH5P33151 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDH5P33151 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDH5P33151 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CDH5P33151 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDH5P33151 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDH5P33151 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDH5P33151 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDH5P33151 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CDH5P33151 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDH5P33151 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDH5P33151 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDH5P33151 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDH5P33151 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDH5P33151 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDH5P33151 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDH5P33151 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDH5P33151 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDH5P33151 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms