Protein–RNA interactions for Protein: P28715

ERCC5, DNA repair protein complementing XP-G cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC5P28715 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ERCC5P28715 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ERCC5P28715 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ERCC5P28715 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ERCC5P28715 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ERCC5P28715 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ERCC5P28715 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ERCC5P28715 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ERCC5P28715 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ERCC5P28715 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ERCC5P28715 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ERCC5P28715 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ERCC5P28715 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ERCC5P28715 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ERCC5P28715 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ERCC5P28715 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ERCC5P28715 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ERCC5P28715 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ERCC5P28715 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ERCC5P28715 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ERCC5P28715 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ERCC5P28715 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ERCC5P28715 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ERCC5P28715 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ERCC5P28715 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ERCC5P28715 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ERCC5P28715 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ERCC5P28715 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ERCC5P28715 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ERCC5P28715 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ERCC5P28715 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
ERCC5P28715 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ERCC5P28715 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ERCC5P28715 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ERCC5P28715 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ERCC5P28715 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ERCC5P28715 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ERCC5P28715 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ERCC5P28715 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ERCC5P28715 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ERCC5P28715 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ERCC5P28715 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ERCC5P28715 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ERCC5P28715 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ERCC5P28715 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ERCC5P28715 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ERCC5P28715 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ERCC5P28715 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ERCC5P28715 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ERCC5P28715 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ERCC5P28715 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ERCC5P28715 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ERCC5P28715 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ERCC5P28715 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ERCC5P28715 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ERCC5P28715 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ERCC5P28715 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ERCC5P28715 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ERCC5P28715 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ERCC5P28715 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ERCC5P28715 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ERCC5P28715 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ERCC5P28715 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ERCC5P28715 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ERCC5P28715 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ERCC5P28715 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ERCC5P28715 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ERCC5P28715 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ERCC5P28715 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ERCC5P28715 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ERCC5P28715 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ERCC5P28715 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ERCC5P28715 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ERCC5P28715 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ERCC5P28715 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ERCC5P28715 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
ERCC5P28715 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ERCC5P28715 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ERCC5P28715 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ERCC5P28715 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ERCC5P28715 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ERCC5P28715 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ERCC5P28715 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ERCC5P28715 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ERCC5P28715 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ERCC5P28715 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ERCC5P28715 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ERCC5P28715 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ERCC5P28715 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ERCC5P28715 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ERCC5P28715 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ERCC5P28715 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ERCC5P28715 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ERCC5P28715 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ERCC5P28715 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ERCC5P28715 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ERCC5P28715 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ERCC5P28715 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ERCC5P28715 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ERCC5P28715 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 208.8 ms