Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HOXD10P28358 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HOXD10P28358 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HOXD10P28358 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HOXD10P28358 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HOXD10P28358 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HOXD10P28358 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HOXD10P28358 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HOXD10P28358 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
HOXD10P28358 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HOXD10P28358 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HOXD10P28358 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HOXD10P28358 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HOXD10P28358 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HOXD10P28358 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HOXD10P28358 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HOXD10P28358 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HOXD10P28358 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HOXD10P28358 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HOXD10P28358 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HOXD10P28358 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
HOXD10P28358 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
HOXD10P28358 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
HOXD10P28358 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
HOXD10P28358 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HOXD10P28358 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HOXD10P28358 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HOXD10P28358 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HOXD10P28358 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
HOXD10P28358 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HOXD10P28358 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HOXD10P28358 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HOXD10P28358 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HOXD10P28358 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HOXD10P28358 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
HOXD10P28358 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HOXD10P28358 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HOXD10P28358 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HOXD10P28358 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HOXD10P28358 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HOXD10P28358 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HOXD10P28358 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
HOXD10P28358 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HOXD10P28358 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
HOXD10P28358 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HOXD10P28358 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HOXD10P28358 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HOXD10P28358 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
HOXD10P28358 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HOXD10P28358 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HOXD10P28358 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HOXD10P28358 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HOXD10P28358 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
HOXD10P28358 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
HOXD10P28358 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HOXD10P28358 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HOXD10P28358 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HOXD10P28358 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HOXD10P28358 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HOXD10P28358 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HOXD10P28358 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
HOXD10P28358 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HOXD10P28358 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
HOXD10P28358 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HOXD10P28358 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HOXD10P28358 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HOXD10P28358 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HOXD10P28358 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HOXD10P28358 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HOXD10P28358 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HOXD10P28358 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HOXD10P28358 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
HOXD10P28358 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HOXD10P28358 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HOXD10P28358 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HOXD10P28358 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HOXD10P28358 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HOXD10P28358 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
HOXD10P28358 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HOXD10P28358 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HOXD10P28358 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HOXD10P28358 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HOXD10P28358 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
HOXD10P28358 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HOXD10P28358 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HOXD10P28358 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HOXD10P28358 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
HOXD10P28358 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HOXD10P28358 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HOXD10P28358 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HOXD10P28358 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HOXD10P28358 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HOXD10P28358 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HOXD10P28358 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HOXD10P28358 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HOXD10P28358 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HOXD10P28358 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HOXD10P28358 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HOXD10P28358 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HOXD10P28358 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 987.3 ms