Protein–RNA interactions for Protein: P21675

TAF1, Transcription initiation factor TFIID subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1P21675 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TAF1P21675 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
TAF1P21675 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TAF1P21675 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
TAF1P21675 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TAF1P21675 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
TAF1P21675 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TAF1P21675 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TAF1P21675 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TAF1P21675 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TAF1P21675 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TAF1P21675 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TAF1P21675 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TAF1P21675 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TAF1P21675 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TAF1P21675 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TAF1P21675 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TAF1P21675 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TAF1P21675 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
TAF1P21675 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TAF1P21675 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TAF1P21675 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TAF1P21675 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TAF1P21675 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TAF1P21675 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
TAF1P21675 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
TAF1P21675 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TAF1P21675 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TAF1P21675 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TAF1P21675 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TAF1P21675 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TAF1P21675 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TAF1P21675 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TAF1P21675 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
TAF1P21675 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TAF1P21675 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TAF1P21675 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TAF1P21675 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TAF1P21675 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TAF1P21675 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TAF1P21675 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TAF1P21675 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TAF1P21675 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TAF1P21675 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TAF1P21675 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TAF1P21675 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TAF1P21675 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TAF1P21675 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TAF1P21675 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TAF1P21675 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TAF1P21675 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TAF1P21675 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TAF1P21675 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TAF1P21675 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TAF1P21675 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TAF1P21675 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TAF1P21675 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TAF1P21675 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TAF1P21675 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TAF1P21675 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TAF1P21675 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TAF1P21675 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TAF1P21675 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TAF1P21675 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TAF1P21675 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
TAF1P21675 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
TAF1P21675 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TAF1P21675 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TAF1P21675 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TAF1P21675 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TAF1P21675 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TAF1P21675 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TAF1P21675 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TAF1P21675 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TAF1P21675 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TAF1P21675 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
TAF1P21675 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TAF1P21675 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TAF1P21675 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
TAF1P21675 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TAF1P21675 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TAF1P21675 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
TAF1P21675 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
TAF1P21675 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TAF1P21675 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TAF1P21675 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TAF1P21675 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TAF1P21675 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TAF1P21675 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TAF1P21675 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TAF1P21675 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TAF1P21675 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TAF1P21675 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TAF1P21675 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TAF1P21675 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TAF1P21675 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TAF1P21675 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TAF1P21675 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TAF1P21675 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TAF1P21675 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms