Protein–RNA interactions for Protein: P13164

IFITM1, Interferon-induced transmembrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM1P13164 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFITM1P13164 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFITM1P13164 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFITM1P13164 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFITM1P13164 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFITM1P13164 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFITM1P13164 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFITM1P13164 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFITM1P13164 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
IFITM1P13164 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
IFITM1P13164 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFITM1P13164 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFITM1P13164 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFITM1P13164 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFITM1P13164 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFITM1P13164 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFITM1P13164 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFITM1P13164 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFITM1P13164 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFITM1P13164 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
IFITM1P13164 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFITM1P13164 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFITM1P13164 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFITM1P13164 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFITM1P13164 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
IFITM1P13164 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFITM1P13164 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFITM1P13164 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFITM1P13164 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFITM1P13164 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFITM1P13164 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFITM1P13164 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFITM1P13164 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFITM1P13164 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFITM1P13164 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFITM1P13164 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFITM1P13164 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFITM1P13164 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFITM1P13164 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFITM1P13164 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFITM1P13164 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFITM1P13164 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFITM1P13164 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFITM1P13164 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFITM1P13164 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFITM1P13164 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFITM1P13164 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFITM1P13164 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFITM1P13164 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFITM1P13164 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFITM1P13164 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
IFITM1P13164 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFITM1P13164 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFITM1P13164 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
IFITM1P13164 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFITM1P13164 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFITM1P13164 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
IFITM1P13164 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
IFITM1P13164 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IFITM1P13164 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IFITM1P13164 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IFITM1P13164 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IFITM1P13164 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IFITM1P13164 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IFITM1P13164 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IFITM1P13164 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IFITM1P13164 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IFITM1P13164 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFITM1P13164 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFITM1P13164 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFITM1P13164 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFITM1P13164 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFITM1P13164 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFITM1P13164 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFITM1P13164 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFITM1P13164 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFITM1P13164 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFITM1P13164 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFITM1P13164 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFITM1P13164 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFITM1P13164 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFITM1P13164 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFITM1P13164 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFITM1P13164 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFITM1P13164 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFITM1P13164 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFITM1P13164 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFITM1P13164 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFITM1P13164 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
IFITM1P13164 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFITM1P13164 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFITM1P13164 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFITM1P13164 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFITM1P13164 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFITM1P13164 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFITM1P13164 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFITM1P13164 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFITM1P13164 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFITM1P13164 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFITM1P13164 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms