Protein–RNA interactions for Protein: P11532

DMD, Dystrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMDP11532 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DMDP11532 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DMDP11532 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DMDP11532 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DMDP11532 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DMDP11532 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DMDP11532 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DMDP11532 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DMDP11532 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DMDP11532 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DMDP11532 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DMDP11532 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DMDP11532 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DMDP11532 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
DMDP11532 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DMDP11532 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DMDP11532 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DMDP11532 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DMDP11532 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DMDP11532 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DMDP11532 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DMDP11532 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DMDP11532 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DMDP11532 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DMDP11532 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DMDP11532 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DMDP11532 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DMDP11532 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DMDP11532 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DMDP11532 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DMDP11532 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DMDP11532 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DMDP11532 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DMDP11532 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DMDP11532 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DMDP11532 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
DMDP11532 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
DMDP11532 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DMDP11532 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DMDP11532 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
DMDP11532 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
DMDP11532 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DMDP11532 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DMDP11532 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DMDP11532 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DMDP11532 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
DMDP11532 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
DMDP11532 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
DMDP11532 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
DMDP11532 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
DMDP11532 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
DMDP11532 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DMDP11532 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DMDP11532 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DMDP11532 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DMDP11532 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
DMDP11532 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DMDP11532 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DMDP11532 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DMDP11532 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
DMDP11532 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DMDP11532 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DMDP11532 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DMDP11532 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DMDP11532 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
DMDP11532 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DMDP11532 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DMDP11532 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
DMDP11532 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DMDP11532 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DMDP11532 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DMDP11532 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DMDP11532 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DMDP11532 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DMDP11532 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DMDP11532 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DMDP11532 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DMDP11532 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DMDP11532 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DMDP11532 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DMDP11532 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DMDP11532 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
DMDP11532 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DMDP11532 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DMDP11532 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
DMDP11532 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
DMDP11532 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DMDP11532 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DMDP11532 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DMDP11532 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DMDP11532 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DMDP11532 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DMDP11532 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DMDP11532 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DMDP11532 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DMDP11532 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DMDP11532 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DMDP11532 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DMDP11532 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
DMDP11532 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms