Protein–RNA interactions for Protein: P04632

CAPNS1, Calpain small subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1P04632 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CAPNS1P04632 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CAPNS1P04632 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CAPNS1P04632 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CAPNS1P04632 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAPNS1P04632 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CAPNS1P04632 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAPNS1P04632 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAPNS1P04632 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAPNS1P04632 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAPNS1P04632 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CAPNS1P04632 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAPNS1P04632 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAPNS1P04632 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPNS1P04632 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPNS1P04632 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPNS1P04632 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPNS1P04632 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPNS1P04632 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPNS1P04632 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPNS1P04632 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPNS1P04632 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPNS1P04632 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPNS1P04632 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPNS1P04632 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPNS1P04632 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPNS1P04632 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAPNS1P04632 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAPNS1P04632 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAPNS1P04632 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAPNS1P04632 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAPNS1P04632 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAPNS1P04632 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAPNS1P04632 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAPNS1P04632 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAPNS1P04632 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAPNS1P04632 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAPNS1P04632 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAPNS1P04632 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAPNS1P04632 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAPNS1P04632 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAPNS1P04632 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAPNS1P04632 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAPNS1P04632 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAPNS1P04632 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAPNS1P04632 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAPNS1P04632 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAPNS1P04632 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAPNS1P04632 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAPNS1P04632 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAPNS1P04632 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAPNS1P04632 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CAPNS1P04632 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAPNS1P04632 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAPNS1P04632 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAPNS1P04632 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAPNS1P04632 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAPNS1P04632 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAPNS1P04632 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAPNS1P04632 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAPNS1P04632 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAPNS1P04632 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAPNS1P04632 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAPNS1P04632 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAPNS1P04632 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAPNS1P04632 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAPNS1P04632 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAPNS1P04632 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAPNS1P04632 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAPNS1P04632 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CAPNS1P04632 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPNS1P04632 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPNS1P04632 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPNS1P04632 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPNS1P04632 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPNS1P04632 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPNS1P04632 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPNS1P04632 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPNS1P04632 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPNS1P04632 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPNS1P04632 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPNS1P04632 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPNS1P04632 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPNS1P04632 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPNS1P04632 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPNS1P04632 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPNS1P04632 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPNS1P04632 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPNS1P04632 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPNS1P04632 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPNS1P04632 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAPNS1P04632 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAPNS1P04632 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAPNS1P04632 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAPNS1P04632 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAPNS1P04632 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAPNS1P04632 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAPNS1P04632 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAPNS1P04632 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAPNS1P04632 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms