Protein–RNA interactions for Protein: O60481

ZIC3, Zinc finger protein ZIC 3, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC3O60481 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZIC3O60481 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZIC3O60481 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZIC3O60481 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZIC3O60481 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZIC3O60481 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZIC3O60481 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZIC3O60481 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZIC3O60481 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZIC3O60481 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZIC3O60481 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZIC3O60481 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZIC3O60481 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ZIC3O60481 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ZIC3O60481 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZIC3O60481 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZIC3O60481 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZIC3O60481 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZIC3O60481 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZIC3O60481 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZIC3O60481 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZIC3O60481 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZIC3O60481 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZIC3O60481 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZIC3O60481 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZIC3O60481 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZIC3O60481 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZIC3O60481 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZIC3O60481 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZIC3O60481 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ZIC3O60481 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZIC3O60481 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZIC3O60481 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZIC3O60481 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZIC3O60481 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZIC3O60481 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZIC3O60481 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZIC3O60481 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZIC3O60481 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZIC3O60481 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZIC3O60481 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ZIC3O60481 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZIC3O60481 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZIC3O60481 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZIC3O60481 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZIC3O60481 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZIC3O60481 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZIC3O60481 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZIC3O60481 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZIC3O60481 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZIC3O60481 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZIC3O60481 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZIC3O60481 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ZIC3O60481 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ZIC3O60481 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ZIC3O60481 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ZIC3O60481 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ZIC3O60481 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZIC3O60481 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZIC3O60481 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZIC3O60481 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZIC3O60481 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZIC3O60481 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZIC3O60481 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZIC3O60481 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZIC3O60481 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZIC3O60481 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZIC3O60481 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZIC3O60481 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZIC3O60481 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZIC3O60481 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZIC3O60481 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZIC3O60481 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZIC3O60481 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZIC3O60481 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZIC3O60481 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZIC3O60481 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZIC3O60481 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZIC3O60481 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZIC3O60481 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZIC3O60481 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZIC3O60481 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZIC3O60481 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZIC3O60481 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZIC3O60481 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZIC3O60481 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZIC3O60481 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZIC3O60481 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZIC3O60481 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZIC3O60481 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZIC3O60481 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZIC3O60481 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZIC3O60481 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZIC3O60481 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZIC3O60481 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZIC3O60481 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZIC3O60481 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZIC3O60481 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZIC3O60481 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZIC3O60481 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms