Protein–RNA interactions for Protein: O43815

STRN, Striatin, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRNO43815 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
STRNO43815 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
STRNO43815 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
STRNO43815 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
STRNO43815 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
STRNO43815 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
STRNO43815 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
STRNO43815 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
STRNO43815 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
STRNO43815 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
STRNO43815 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
STRNO43815 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
STRNO43815 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
STRNO43815 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
STRNO43815 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
STRNO43815 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
STRNO43815 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
STRNO43815 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
STRNO43815 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
STRNO43815 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
STRNO43815 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
STRNO43815 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
STRNO43815 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
STRNO43815 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
STRNO43815 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
STRNO43815 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
STRNO43815 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
STRNO43815 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
STRNO43815 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
STRNO43815 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
STRNO43815 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
STRNO43815 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
STRNO43815 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
STRNO43815 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
STRNO43815 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
STRNO43815 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
STRNO43815 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
STRNO43815 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
STRNO43815 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
STRNO43815 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
STRNO43815 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
STRNO43815 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
STRNO43815 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
STRNO43815 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
STRNO43815 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
STRNO43815 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
STRNO43815 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
STRNO43815 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
STRNO43815 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
STRNO43815 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
STRNO43815 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
STRNO43815 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
STRNO43815 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
STRNO43815 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
STRNO43815 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
STRNO43815 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
STRNO43815 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
STRNO43815 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
STRNO43815 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
STRNO43815 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
STRNO43815 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
STRNO43815 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
STRNO43815 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
STRNO43815 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
STRNO43815 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
STRNO43815 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
STRNO43815 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
STRNO43815 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
STRNO43815 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
STRNO43815 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
STRNO43815 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
STRNO43815 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
STRNO43815 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
STRNO43815 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
STRNO43815 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
STRNO43815 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
STRNO43815 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
STRNO43815 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
STRNO43815 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
STRNO43815 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
STRNO43815 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
STRNO43815 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
STRNO43815 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
STRNO43815 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
STRNO43815 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
STRNO43815 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
STRNO43815 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
STRNO43815 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
STRNO43815 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
STRNO43815 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
STRNO43815 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
STRNO43815 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
STRNO43815 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
STRNO43815 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
STRNO43815 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
STRNO43815 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
STRNO43815 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
STRNO43815 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
STRNO43815 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
STRNO43815 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms