Protein–RNA interactions for Protein: O00237

RNF103, E3 ubiquitin-protein ligase RNF103, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF103O00237 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF103O00237 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF103O00237 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF103O00237 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF103O00237 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF103O00237 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF103O00237 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF103O00237 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF103O00237 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF103O00237 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF103O00237 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF103O00237 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF103O00237 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF103O00237 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF103O00237 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF103O00237 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF103O00237 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF103O00237 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF103O00237 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF103O00237 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF103O00237 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF103O00237 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF103O00237 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF103O00237 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF103O00237 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF103O00237 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF103O00237 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF103O00237 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF103O00237 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF103O00237 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF103O00237 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF103O00237 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF103O00237 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF103O00237 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF103O00237 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF103O00237 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF103O00237 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF103O00237 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF103O00237 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF103O00237 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF103O00237 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF103O00237 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF103O00237 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF103O00237 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF103O00237 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF103O00237 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RNF103O00237 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RNF103O00237 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RNF103O00237 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RNF103O00237 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RNF103O00237 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RNF103O00237 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RNF103O00237 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
RNF103O00237 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RNF103O00237 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RNF103O00237 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RNF103O00237 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RNF103O00237 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RNF103O00237 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RNF103O00237 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RNF103O00237 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RNF103O00237 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF103O00237 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF103O00237 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF103O00237 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF103O00237 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF103O00237 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF103O00237 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF103O00237 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF103O00237 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF103O00237 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF103O00237 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF103O00237 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF103O00237 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF103O00237 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF103O00237 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF103O00237 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF103O00237 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF103O00237 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF103O00237 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF103O00237 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF103O00237 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF103O00237 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF103O00237 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF103O00237 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF103O00237 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF103O00237 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF103O00237 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF103O00237 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF103O00237 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF103O00237 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF103O00237 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF103O00237 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF103O00237 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF103O00237 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF103O00237 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF103O00237 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF103O00237 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF103O00237 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF103O00237 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms