Protein–RNA interactions for Protein: B5ME19

EIF3CL, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit C-like protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3CLB5ME19 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
EIF3CLB5ME19 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
EIF3CLB5ME19 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
EIF3CLB5ME19 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
EIF3CLB5ME19 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
EIF3CLB5ME19 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EIF3CLB5ME19 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EIF3CLB5ME19 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
EIF3CLB5ME19 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
EIF3CLB5ME19 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EIF3CLB5ME19 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
EIF3CLB5ME19 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
EIF3CLB5ME19 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EIF3CLB5ME19 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
EIF3CLB5ME19 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EIF3CLB5ME19 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EIF3CLB5ME19 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EIF3CLB5ME19 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EIF3CLB5ME19 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EIF3CLB5ME19 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EIF3CLB5ME19 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EIF3CLB5ME19 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
EIF3CLB5ME19 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EIF3CLB5ME19 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EIF3CLB5ME19 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EIF3CLB5ME19 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EIF3CLB5ME19 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EIF3CLB5ME19 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EIF3CLB5ME19 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EIF3CLB5ME19 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EIF3CLB5ME19 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EIF3CLB5ME19 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EIF3CLB5ME19 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EIF3CLB5ME19 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
EIF3CLB5ME19 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EIF3CLB5ME19 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EIF3CLB5ME19 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EIF3CLB5ME19 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EIF3CLB5ME19 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EIF3CLB5ME19 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EIF3CLB5ME19 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EIF3CLB5ME19 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EIF3CLB5ME19 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EIF3CLB5ME19 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EIF3CLB5ME19 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EIF3CLB5ME19 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EIF3CLB5ME19 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EIF3CLB5ME19 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EIF3CLB5ME19 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EIF3CLB5ME19 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EIF3CLB5ME19 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EIF3CLB5ME19 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EIF3CLB5ME19 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EIF3CLB5ME19 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EIF3CLB5ME19 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EIF3CLB5ME19 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EIF3CLB5ME19 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EIF3CLB5ME19 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EIF3CLB5ME19 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EIF3CLB5ME19 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EIF3CLB5ME19 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EIF3CLB5ME19 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EIF3CLB5ME19 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EIF3CLB5ME19 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EIF3CLB5ME19 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EIF3CLB5ME19 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EIF3CLB5ME19 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EIF3CLB5ME19 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EIF3CLB5ME19 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EIF3CLB5ME19 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EIF3CLB5ME19 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EIF3CLB5ME19 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EIF3CLB5ME19 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EIF3CLB5ME19 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EIF3CLB5ME19 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EIF3CLB5ME19 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EIF3CLB5ME19 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EIF3CLB5ME19 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EIF3CLB5ME19 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EIF3CLB5ME19 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
EIF3CLB5ME19 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EIF3CLB5ME19 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EIF3CLB5ME19 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EIF3CLB5ME19 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EIF3CLB5ME19 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EIF3CLB5ME19 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
EIF3CLB5ME19 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EIF3CLB5ME19 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EIF3CLB5ME19 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EIF3CLB5ME19 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EIF3CLB5ME19 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EIF3CLB5ME19 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EIF3CLB5ME19 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EIF3CLB5ME19 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EIF3CLB5ME19 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EIF3CLB5ME19 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EIF3CLB5ME19 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EIF3CLB5ME19 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EIF3CLB5ME19 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EIF3CLB5ME19 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms