Protein–RNA interactions for Protein: B5MD39

GGTLC3, Putative glutathione hydrolase light chain 3, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGTLC3B5MD39 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GGTLC3B5MD39 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GGTLC3B5MD39 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GGTLC3B5MD39 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GGTLC3B5MD39 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GGTLC3B5MD39 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GGTLC3B5MD39 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GGTLC3B5MD39 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GGTLC3B5MD39 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GGTLC3B5MD39 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GGTLC3B5MD39 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
GGTLC3B5MD39 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GGTLC3B5MD39 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GGTLC3B5MD39 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GGTLC3B5MD39 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GGTLC3B5MD39 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GGTLC3B5MD39 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GGTLC3B5MD39 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GGTLC3B5MD39 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GGTLC3B5MD39 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GGTLC3B5MD39 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GGTLC3B5MD39 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GGTLC3B5MD39 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GGTLC3B5MD39 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
GGTLC3B5MD39 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GGTLC3B5MD39 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GGTLC3B5MD39 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GGTLC3B5MD39 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GGTLC3B5MD39 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GGTLC3B5MD39 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GGTLC3B5MD39 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GGTLC3B5MD39 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GGTLC3B5MD39 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GGTLC3B5MD39 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GGTLC3B5MD39 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GGTLC3B5MD39 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GGTLC3B5MD39 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
GGTLC3B5MD39 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GGTLC3B5MD39 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GGTLC3B5MD39 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GGTLC3B5MD39 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GGTLC3B5MD39 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GGTLC3B5MD39 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GGTLC3B5MD39 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GGTLC3B5MD39 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GGTLC3B5MD39 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GGTLC3B5MD39 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GGTLC3B5MD39 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GGTLC3B5MD39 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GGTLC3B5MD39 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GGTLC3B5MD39 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
GGTLC3B5MD39 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GGTLC3B5MD39 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
GGTLC3B5MD39 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GGTLC3B5MD39 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
GGTLC3B5MD39 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GGTLC3B5MD39 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GGTLC3B5MD39 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GGTLC3B5MD39 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GGTLC3B5MD39 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GGTLC3B5MD39 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GGTLC3B5MD39 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GGTLC3B5MD39 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GGTLC3B5MD39 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GGTLC3B5MD39 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GGTLC3B5MD39 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GGTLC3B5MD39 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GGTLC3B5MD39 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GGTLC3B5MD39 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GGTLC3B5MD39 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GGTLC3B5MD39 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GGTLC3B5MD39 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GGTLC3B5MD39 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GGTLC3B5MD39 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GGTLC3B5MD39 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GGTLC3B5MD39 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GGTLC3B5MD39 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
GGTLC3B5MD39 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GGTLC3B5MD39 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GGTLC3B5MD39 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GGTLC3B5MD39 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GGTLC3B5MD39 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GGTLC3B5MD39 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GGTLC3B5MD39 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GGTLC3B5MD39 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GGTLC3B5MD39 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GGTLC3B5MD39 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GGTLC3B5MD39 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GGTLC3B5MD39 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GGTLC3B5MD39 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GGTLC3B5MD39 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GGTLC3B5MD39 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GGTLC3B5MD39 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GGTLC3B5MD39 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GGTLC3B5MD39 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GGTLC3B5MD39 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GGTLC3B5MD39 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GGTLC3B5MD39 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GGTLC3B5MD39 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
GGTLC3B5MD39 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms