Protein–RNA interactions for Protein: A6NM62

LRRC53, Leucine-rich repeat-containing protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 1,247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC53A6NM62 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRC53A6NM62 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRC53A6NM62 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRC53A6NM62 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRC53A6NM62 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRC53A6NM62 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRC53A6NM62 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRC53A6NM62 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRC53A6NM62 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRC53A6NM62 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRC53A6NM62 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRC53A6NM62 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRC53A6NM62 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRC53A6NM62 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRC53A6NM62 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRC53A6NM62 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRC53A6NM62 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRC53A6NM62 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRC53A6NM62 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRC53A6NM62 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRC53A6NM62 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
LRRC53A6NM62 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
LRRC53A6NM62 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
LRRC53A6NM62 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRC53A6NM62 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRC53A6NM62 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRC53A6NM62 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRC53A6NM62 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRC53A6NM62 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRC53A6NM62 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRC53A6NM62 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRC53A6NM62 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRC53A6NM62 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRC53A6NM62 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRC53A6NM62 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRC53A6NM62 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRC53A6NM62 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRC53A6NM62 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC53A6NM62 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC53A6NM62 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC53A6NM62 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC53A6NM62 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC53A6NM62 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC53A6NM62 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC53A6NM62 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC53A6NM62 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC53A6NM62 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC53A6NM62 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC53A6NM62 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC53A6NM62 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC53A6NM62 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC53A6NM62 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC53A6NM62 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC53A6NM62 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRC53A6NM62 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRC53A6NM62 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRC53A6NM62 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRC53A6NM62 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRC53A6NM62 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC53A6NM62 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC53A6NM62 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC53A6NM62 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC53A6NM62 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC53A6NM62 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC53A6NM62 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC53A6NM62 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC53A6NM62 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC53A6NM62 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC53A6NM62 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC53A6NM62 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC53A6NM62 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC53A6NM62 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC53A6NM62 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC53A6NM62 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC53A6NM62 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC53A6NM62 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC53A6NM62 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC53A6NM62 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC53A6NM62 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC53A6NM62 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC53A6NM62 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC53A6NM62 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC53A6NM62 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC53A6NM62 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC53A6NM62 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC53A6NM62 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC53A6NM62 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC53A6NM62 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC53A6NM62 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC53A6NM62 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC53A6NM62 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC53A6NM62 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC53A6NM62 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC53A6NM62 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC53A6NM62 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC53A6NM62 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC53A6NM62 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC53A6NM62 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC53A6NM62 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC53A6NM62 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.4 ms