Protein–RNA interactions for Protein: A6NKU9

SPDYE3, Speedy protein E3, humanhuman

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPDYE3A6NKU9 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SPDYE3A6NKU9 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SPDYE3A6NKU9 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SPDYE3A6NKU9 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SPDYE3A6NKU9 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SPDYE3A6NKU9 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SPDYE3A6NKU9 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SPDYE3A6NKU9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SPDYE3A6NKU9 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SPDYE3A6NKU9 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SPDYE3A6NKU9 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SPDYE3A6NKU9 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SPDYE3A6NKU9 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SPDYE3A6NKU9 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SPDYE3A6NKU9 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SPDYE3A6NKU9 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SPDYE3A6NKU9 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SPDYE3A6NKU9 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SPDYE3A6NKU9 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SPDYE3A6NKU9 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SPDYE3A6NKU9 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SPDYE3A6NKU9 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SPDYE3A6NKU9 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SPDYE3A6NKU9 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SPDYE3A6NKU9 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SPDYE3A6NKU9 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SPDYE3A6NKU9 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SPDYE3A6NKU9 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
SPDYE3A6NKU9 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SPDYE3A6NKU9 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SPDYE3A6NKU9 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SPDYE3A6NKU9 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SPDYE3A6NKU9 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SPDYE3A6NKU9 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SPDYE3A6NKU9 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SPDYE3A6NKU9 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SPDYE3A6NKU9 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SPDYE3A6NKU9 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SPDYE3A6NKU9 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SPDYE3A6NKU9 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SPDYE3A6NKU9 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SPDYE3A6NKU9 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SPDYE3A6NKU9 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SPDYE3A6NKU9 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SPDYE3A6NKU9 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SPDYE3A6NKU9 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SPDYE3A6NKU9 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SPDYE3A6NKU9 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SPDYE3A6NKU9 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SPDYE3A6NKU9 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SPDYE3A6NKU9 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SPDYE3A6NKU9 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SPDYE3A6NKU9 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SPDYE3A6NKU9 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SPDYE3A6NKU9 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SPDYE3A6NKU9 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SPDYE3A6NKU9 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SPDYE3A6NKU9 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SPDYE3A6NKU9 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SPDYE3A6NKU9 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SPDYE3A6NKU9 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SPDYE3A6NKU9 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SPDYE3A6NKU9 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SPDYE3A6NKU9 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SPDYE3A6NKU9 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SPDYE3A6NKU9 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SPDYE3A6NKU9 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SPDYE3A6NKU9 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SPDYE3A6NKU9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SPDYE3A6NKU9 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SPDYE3A6NKU9 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SPDYE3A6NKU9 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SPDYE3A6NKU9 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SPDYE3A6NKU9 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SPDYE3A6NKU9 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SPDYE3A6NKU9 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SPDYE3A6NKU9 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SPDYE3A6NKU9 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SPDYE3A6NKU9 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SPDYE3A6NKU9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SPDYE3A6NKU9 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SPDYE3A6NKU9 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SPDYE3A6NKU9 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SPDYE3A6NKU9 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SPDYE3A6NKU9 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SPDYE3A6NKU9 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SPDYE3A6NKU9 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SPDYE3A6NKU9 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SPDYE3A6NKU9 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SPDYE3A6NKU9 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SPDYE3A6NKU9 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SPDYE3A6NKU9 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SPDYE3A6NKU9 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SPDYE3A6NKU9 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SPDYE3A6NKU9 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SPDYE3A6NKU9 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SPDYE3A6NKU9 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SPDYE3A6NKU9 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SPDYE3A6NKU9 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SPDYE3A6NKU9 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms