Protein–RNA interactions for Protein: A6NDB9

PALM3, Paralemmin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM3A6NDB9 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PALM3A6NDB9 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PALM3A6NDB9 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
PALM3A6NDB9 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PALM3A6NDB9 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PALM3A6NDB9 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PALM3A6NDB9 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PALM3A6NDB9 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PALM3A6NDB9 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PALM3A6NDB9 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PALM3A6NDB9 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PALM3A6NDB9 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PALM3A6NDB9 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PALM3A6NDB9 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PALM3A6NDB9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PALM3A6NDB9 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PALM3A6NDB9 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PALM3A6NDB9 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PALM3A6NDB9 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PALM3A6NDB9 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PALM3A6NDB9 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PALM3A6NDB9 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PALM3A6NDB9 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PALM3A6NDB9 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PALM3A6NDB9 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PALM3A6NDB9 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PALM3A6NDB9 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PALM3A6NDB9 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PALM3A6NDB9 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PALM3A6NDB9 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PALM3A6NDB9 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PALM3A6NDB9 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PALM3A6NDB9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PALM3A6NDB9 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PALM3A6NDB9 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PALM3A6NDB9 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PALM3A6NDB9 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PALM3A6NDB9 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PALM3A6NDB9 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PALM3A6NDB9 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
PALM3A6NDB9 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PALM3A6NDB9 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PALM3A6NDB9 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PALM3A6NDB9 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PALM3A6NDB9 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PALM3A6NDB9 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PALM3A6NDB9 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PALM3A6NDB9 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PALM3A6NDB9 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PALM3A6NDB9 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PALM3A6NDB9 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PALM3A6NDB9 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PALM3A6NDB9 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PALM3A6NDB9 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PALM3A6NDB9 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PALM3A6NDB9 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PALM3A6NDB9 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PALM3A6NDB9 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PALM3A6NDB9 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PALM3A6NDB9 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PALM3A6NDB9 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PALM3A6NDB9 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PALM3A6NDB9 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PALM3A6NDB9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PALM3A6NDB9 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PALM3A6NDB9 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PALM3A6NDB9 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PALM3A6NDB9 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PALM3A6NDB9 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PALM3A6NDB9 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PALM3A6NDB9 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PALM3A6NDB9 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PALM3A6NDB9 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PALM3A6NDB9 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
PALM3A6NDB9 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PALM3A6NDB9 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PALM3A6NDB9 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PALM3A6NDB9 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PALM3A6NDB9 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PALM3A6NDB9 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PALM3A6NDB9 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PALM3A6NDB9 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PALM3A6NDB9 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PALM3A6NDB9 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PALM3A6NDB9 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PALM3A6NDB9 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PALM3A6NDB9 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PALM3A6NDB9 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PALM3A6NDB9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PALM3A6NDB9 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
PALM3A6NDB9 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PALM3A6NDB9 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PALM3A6NDB9 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PALM3A6NDB9 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PALM3A6NDB9 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PALM3A6NDB9 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PALM3A6NDB9 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PALM3A6NDB9 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PALM3A6NDB9 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PALM3A6NDB9 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms