Protein–RNA interactions for Protein: V9GYQ6

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V9GYQ6 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
V9GYQ6 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
V9GYQ6 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
V9GYQ6 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
V9GYQ6 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
V9GYQ6 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
V9GYQ6 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
V9GYQ6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
V9GYQ6 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
V9GYQ6 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
V9GYQ6 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
V9GYQ6 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
V9GYQ6 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
V9GYQ6 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
V9GYQ6 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
V9GYQ6 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
V9GYQ6 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
V9GYQ6 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
V9GYQ6 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
V9GYQ6 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
V9GYQ6 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
V9GYQ6 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
V9GYQ6 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
V9GYQ6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
V9GYQ6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
V9GYQ6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
V9GYQ6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
V9GYQ6 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
V9GYQ6 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
V9GYQ6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
V9GYQ6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
V9GYQ6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
V9GYQ6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
V9GYQ6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
V9GYQ6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
V9GYQ6 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
V9GYQ6 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
V9GYQ6 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
V9GYQ6 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
V9GYQ6 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
V9GYQ6 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
V9GYQ6 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
V9GYQ6 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
V9GYQ6 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
V9GYQ6 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
V9GYQ6 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
V9GYQ6 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
V9GYQ6 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
V9GYQ6 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
V9GYQ6 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
V9GYQ6 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
V9GYQ6 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
V9GYQ6 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
V9GYQ6 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
V9GYQ6 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
V9GYQ6 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
V9GYQ6 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
V9GYQ6 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
V9GYQ6 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
V9GYQ6 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
V9GYQ6 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
V9GYQ6 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
V9GYQ6 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
V9GYQ6 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
V9GYQ6 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
V9GYQ6 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
V9GYQ6 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
V9GYQ6 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
V9GYQ6 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
V9GYQ6 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
V9GYQ6 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
V9GYQ6 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
V9GYQ6 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
V9GYQ6 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
V9GYQ6 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
V9GYQ6 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
V9GYQ6 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
V9GYQ6 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
V9GYQ6 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
V9GYQ6 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
V9GYQ6 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
V9GYQ6 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
V9GYQ6 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
V9GYQ6 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
V9GYQ6 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
V9GYQ6 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
V9GYQ6 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
V9GYQ6 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
V9GYQ6 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
V9GYQ6 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
V9GYQ6 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
V9GYQ6 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
V9GYQ6 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
V9GYQ6 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
V9GYQ6 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
V9GYQ6 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
V9GYQ6 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
V9GYQ6 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
V9GYQ6 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
V9GYQ6 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms