Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q9

NCOA3, Nuclear receptor coactivator 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA3Q9Y6Q9 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
NCOA3Q9Y6Q9 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
NCOA3Q9Y6Q9 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
NCOA3Q9Y6Q9 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
NCOA3Q9Y6Q9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
NCOA3Q9Y6Q9 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
NCOA3Q9Y6Q9 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
NCOA3Q9Y6Q9 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC32.22■■■□□ 2.75
NCOA3Q9Y6Q9 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
NCOA3Q9Y6Q9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
NCOA3Q9Y6Q9 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
NCOA3Q9Y6Q9 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
NCOA3Q9Y6Q9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
NCOA3Q9Y6Q9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
NCOA3Q9Y6Q9 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
NCOA3Q9Y6Q9 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
NCOA3Q9Y6Q9 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
NCOA3Q9Y6Q9 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
NCOA3Q9Y6Q9 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
NCOA3Q9Y6Q9 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
NCOA3Q9Y6Q9 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
NCOA3Q9Y6Q9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
NCOA3Q9Y6Q9 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
NCOA3Q9Y6Q9 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
NCOA3Q9Y6Q9 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
NCOA3Q9Y6Q9 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
NCOA3Q9Y6Q9 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
NCOA3Q9Y6Q9 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
NCOA3Q9Y6Q9 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC32.19■■■□□ 2.74
NCOA3Q9Y6Q9 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
NCOA3Q9Y6Q9 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
NCOA3Q9Y6Q9 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
NCOA3Q9Y6Q9 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
NCOA3Q9Y6Q9 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
NCOA3Q9Y6Q9 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
NCOA3Q9Y6Q9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
NCOA3Q9Y6Q9 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
NCOA3Q9Y6Q9 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
NCOA3Q9Y6Q9 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
NCOA3Q9Y6Q9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
NCOA3Q9Y6Q9 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
NCOA3Q9Y6Q9 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
NCOA3Q9Y6Q9 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
NCOA3Q9Y6Q9 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
NCOA3Q9Y6Q9 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC32.17■■■□□ 2.74
NCOA3Q9Y6Q9 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
NCOA3Q9Y6Q9 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
NCOA3Q9Y6Q9 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
NCOA3Q9Y6Q9 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
NCOA3Q9Y6Q9 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
NCOA3Q9Y6Q9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
NCOA3Q9Y6Q9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
NCOA3Q9Y6Q9 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
NCOA3Q9Y6Q9 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
NCOA3Q9Y6Q9 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
NCOA3Q9Y6Q9 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
NCOA3Q9Y6Q9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
NCOA3Q9Y6Q9 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
NCOA3Q9Y6Q9 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
NCOA3Q9Y6Q9 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
NCOA3Q9Y6Q9 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
NCOA3Q9Y6Q9 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
NCOA3Q9Y6Q9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
NCOA3Q9Y6Q9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
NCOA3Q9Y6Q9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
NCOA3Q9Y6Q9 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
NCOA3Q9Y6Q9 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
NCOA3Q9Y6Q9 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
NCOA3Q9Y6Q9 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
NCOA3Q9Y6Q9 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC32.14■■■□□ 2.74
NCOA3Q9Y6Q9 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
NCOA3Q9Y6Q9 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
NCOA3Q9Y6Q9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
NCOA3Q9Y6Q9 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
NCOA3Q9Y6Q9 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
NCOA3Q9Y6Q9 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
NCOA3Q9Y6Q9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
NCOA3Q9Y6Q9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
NCOA3Q9Y6Q9 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
NCOA3Q9Y6Q9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
NCOA3Q9Y6Q9 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
NCOA3Q9Y6Q9 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
NCOA3Q9Y6Q9 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
NCOA3Q9Y6Q9 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC32.12■■■□□ 2.73
NCOA3Q9Y6Q9 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
NCOA3Q9Y6Q9 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
NCOA3Q9Y6Q9 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
NCOA3Q9Y6Q9 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
NCOA3Q9Y6Q9 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
NCOA3Q9Y6Q9 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
NCOA3Q9Y6Q9 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC32.1■■■□□ 2.73
NCOA3Q9Y6Q9 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
NCOA3Q9Y6Q9 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
NCOA3Q9Y6Q9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
NCOA3Q9Y6Q9 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC32.1■■■□□ 2.73
NCOA3Q9Y6Q9 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
NCOA3Q9Y6Q9 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
NCOA3Q9Y6Q9 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
NCOA3Q9Y6Q9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
NCOA3Q9Y6Q9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms