Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2U8

LEMD3, Inner nuclear membrane protein Man1, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LEMD3Q9Y2U8 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LEMD3Q9Y2U8 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LEMD3Q9Y2U8 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LEMD3Q9Y2U8 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LEMD3Q9Y2U8 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LEMD3Q9Y2U8 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LEMD3Q9Y2U8 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LEMD3Q9Y2U8 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
LEMD3Q9Y2U8 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LEMD3Q9Y2U8 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
LEMD3Q9Y2U8 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LEMD3Q9Y2U8 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LEMD3Q9Y2U8 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LEMD3Q9Y2U8 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
LEMD3Q9Y2U8 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LEMD3Q9Y2U8 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LEMD3Q9Y2U8 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
LEMD3Q9Y2U8 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LEMD3Q9Y2U8 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LEMD3Q9Y2U8 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LEMD3Q9Y2U8 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LEMD3Q9Y2U8 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LEMD3Q9Y2U8 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LEMD3Q9Y2U8 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LEMD3Q9Y2U8 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LEMD3Q9Y2U8 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LEMD3Q9Y2U8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LEMD3Q9Y2U8 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LEMD3Q9Y2U8 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LEMD3Q9Y2U8 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
LEMD3Q9Y2U8 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LEMD3Q9Y2U8 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
LEMD3Q9Y2U8 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LEMD3Q9Y2U8 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LEMD3Q9Y2U8 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LEMD3Q9Y2U8 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LEMD3Q9Y2U8 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
LEMD3Q9Y2U8 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LEMD3Q9Y2U8 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LEMD3Q9Y2U8 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LEMD3Q9Y2U8 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LEMD3Q9Y2U8 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
LEMD3Q9Y2U8 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
LEMD3Q9Y2U8 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LEMD3Q9Y2U8 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LEMD3Q9Y2U8 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LEMD3Q9Y2U8 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
LEMD3Q9Y2U8 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LEMD3Q9Y2U8 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LEMD3Q9Y2U8 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LEMD3Q9Y2U8 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LEMD3Q9Y2U8 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LEMD3Q9Y2U8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LEMD3Q9Y2U8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LEMD3Q9Y2U8 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LEMD3Q9Y2U8 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
LEMD3Q9Y2U8 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LEMD3Q9Y2U8 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LEMD3Q9Y2U8 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LEMD3Q9Y2U8 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LEMD3Q9Y2U8 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LEMD3Q9Y2U8 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
LEMD3Q9Y2U8 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
LEMD3Q9Y2U8 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
LEMD3Q9Y2U8 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LEMD3Q9Y2U8 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LEMD3Q9Y2U8 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LEMD3Q9Y2U8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LEMD3Q9Y2U8 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
LEMD3Q9Y2U8 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
LEMD3Q9Y2U8 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LEMD3Q9Y2U8 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
LEMD3Q9Y2U8 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LEMD3Q9Y2U8 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
LEMD3Q9Y2U8 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LEMD3Q9Y2U8 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LEMD3Q9Y2U8 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LEMD3Q9Y2U8 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LEMD3Q9Y2U8 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LEMD3Q9Y2U8 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LEMD3Q9Y2U8 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LEMD3Q9Y2U8 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LEMD3Q9Y2U8 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LEMD3Q9Y2U8 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LEMD3Q9Y2U8 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LEMD3Q9Y2U8 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LEMD3Q9Y2U8 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LEMD3Q9Y2U8 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LEMD3Q9Y2U8 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LEMD3Q9Y2U8 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LEMD3Q9Y2U8 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LEMD3Q9Y2U8 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LEMD3Q9Y2U8 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LEMD3Q9Y2U8 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LEMD3Q9Y2U8 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LEMD3Q9Y2U8 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LEMD3Q9Y2U8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LEMD3Q9Y2U8 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
LEMD3Q9Y2U8 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LEMD3Q9Y2U8 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms