Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL0

RCOR1, REST corepressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCOR1Q9UKL0 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RCOR1Q9UKL0 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
RCOR1Q9UKL0 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RCOR1Q9UKL0 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RCOR1Q9UKL0 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RCOR1Q9UKL0 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RCOR1Q9UKL0 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RCOR1Q9UKL0 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RCOR1Q9UKL0 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RCOR1Q9UKL0 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
RCOR1Q9UKL0 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RCOR1Q9UKL0 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RCOR1Q9UKL0 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
RCOR1Q9UKL0 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
RCOR1Q9UKL0 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
RCOR1Q9UKL0 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
RCOR1Q9UKL0 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
RCOR1Q9UKL0 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
RCOR1Q9UKL0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
RCOR1Q9UKL0 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RCOR1Q9UKL0 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RCOR1Q9UKL0 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RCOR1Q9UKL0 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RCOR1Q9UKL0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RCOR1Q9UKL0 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RCOR1Q9UKL0 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RCOR1Q9UKL0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RCOR1Q9UKL0 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RCOR1Q9UKL0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RCOR1Q9UKL0 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RCOR1Q9UKL0 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RCOR1Q9UKL0 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
RCOR1Q9UKL0 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RCOR1Q9UKL0 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RCOR1Q9UKL0 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RCOR1Q9UKL0 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RCOR1Q9UKL0 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RCOR1Q9UKL0 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RCOR1Q9UKL0 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
RCOR1Q9UKL0 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RCOR1Q9UKL0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RCOR1Q9UKL0 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RCOR1Q9UKL0 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RCOR1Q9UKL0 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RCOR1Q9UKL0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RCOR1Q9UKL0 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RCOR1Q9UKL0 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RCOR1Q9UKL0 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RCOR1Q9UKL0 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RCOR1Q9UKL0 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RCOR1Q9UKL0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RCOR1Q9UKL0 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RCOR1Q9UKL0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RCOR1Q9UKL0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RCOR1Q9UKL0 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RCOR1Q9UKL0 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RCOR1Q9UKL0 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RCOR1Q9UKL0 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RCOR1Q9UKL0 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RCOR1Q9UKL0 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
RCOR1Q9UKL0 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RCOR1Q9UKL0 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RCOR1Q9UKL0 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RCOR1Q9UKL0 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RCOR1Q9UKL0 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RCOR1Q9UKL0 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RCOR1Q9UKL0 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RCOR1Q9UKL0 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RCOR1Q9UKL0 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RCOR1Q9UKL0 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RCOR1Q9UKL0 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RCOR1Q9UKL0 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RCOR1Q9UKL0 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RCOR1Q9UKL0 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RCOR1Q9UKL0 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RCOR1Q9UKL0 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RCOR1Q9UKL0 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RCOR1Q9UKL0 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RCOR1Q9UKL0 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
RCOR1Q9UKL0 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RCOR1Q9UKL0 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RCOR1Q9UKL0 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RCOR1Q9UKL0 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RCOR1Q9UKL0 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RCOR1Q9UKL0 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RCOR1Q9UKL0 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RCOR1Q9UKL0 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
RCOR1Q9UKL0 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RCOR1Q9UKL0 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RCOR1Q9UKL0 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RCOR1Q9UKL0 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RCOR1Q9UKL0 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RCOR1Q9UKL0 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RCOR1Q9UKL0 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RCOR1Q9UKL0 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RCOR1Q9UKL0 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RCOR1Q9UKL0 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RCOR1Q9UKL0 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RCOR1Q9UKL0 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
RCOR1Q9UKL0 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms