Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI3

VPREB3, Pre-B lymphocyte protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB3Q9UKI3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VPREB3Q9UKI3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VPREB3Q9UKI3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VPREB3Q9UKI3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VPREB3Q9UKI3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VPREB3Q9UKI3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VPREB3Q9UKI3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VPREB3Q9UKI3 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VPREB3Q9UKI3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VPREB3Q9UKI3 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VPREB3Q9UKI3 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VPREB3Q9UKI3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VPREB3Q9UKI3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
VPREB3Q9UKI3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VPREB3Q9UKI3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VPREB3Q9UKI3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VPREB3Q9UKI3 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VPREB3Q9UKI3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VPREB3Q9UKI3 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VPREB3Q9UKI3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPREB3Q9UKI3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPREB3Q9UKI3 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPREB3Q9UKI3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPREB3Q9UKI3 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPREB3Q9UKI3 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPREB3Q9UKI3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPREB3Q9UKI3 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPREB3Q9UKI3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPREB3Q9UKI3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VPREB3Q9UKI3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VPREB3Q9UKI3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VPREB3Q9UKI3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VPREB3Q9UKI3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VPREB3Q9UKI3 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VPREB3Q9UKI3 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VPREB3Q9UKI3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VPREB3Q9UKI3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VPREB3Q9UKI3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VPREB3Q9UKI3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VPREB3Q9UKI3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VPREB3Q9UKI3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VPREB3Q9UKI3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VPREB3Q9UKI3 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VPREB3Q9UKI3 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
VPREB3Q9UKI3 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
VPREB3Q9UKI3 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VPREB3Q9UKI3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VPREB3Q9UKI3 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
VPREB3Q9UKI3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
VPREB3Q9UKI3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VPREB3Q9UKI3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VPREB3Q9UKI3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VPREB3Q9UKI3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VPREB3Q9UKI3 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
VPREB3Q9UKI3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VPREB3Q9UKI3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VPREB3Q9UKI3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VPREB3Q9UKI3 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
VPREB3Q9UKI3 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VPREB3Q9UKI3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VPREB3Q9UKI3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VPREB3Q9UKI3 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VPREB3Q9UKI3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VPREB3Q9UKI3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VPREB3Q9UKI3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VPREB3Q9UKI3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VPREB3Q9UKI3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VPREB3Q9UKI3 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VPREB3Q9UKI3 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VPREB3Q9UKI3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VPREB3Q9UKI3 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VPREB3Q9UKI3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VPREB3Q9UKI3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VPREB3Q9UKI3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VPREB3Q9UKI3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
VPREB3Q9UKI3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VPREB3Q9UKI3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
VPREB3Q9UKI3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VPREB3Q9UKI3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VPREB3Q9UKI3 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
VPREB3Q9UKI3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VPREB3Q9UKI3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VPREB3Q9UKI3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VPREB3Q9UKI3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VPREB3Q9UKI3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VPREB3Q9UKI3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VPREB3Q9UKI3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VPREB3Q9UKI3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VPREB3Q9UKI3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VPREB3Q9UKI3 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VPREB3Q9UKI3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VPREB3Q9UKI3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VPREB3Q9UKI3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VPREB3Q9UKI3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VPREB3Q9UKI3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VPREB3Q9UKI3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VPREB3Q9UKI3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VPREB3Q9UKI3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VPREB3Q9UKI3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VPREB3Q9UKI3 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms