Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH36

SRRD, SRR1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRDQ9UH36 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SRRDQ9UH36 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SRRDQ9UH36 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SRRDQ9UH36 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SRRDQ9UH36 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SRRDQ9UH36 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SRRDQ9UH36 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SRRDQ9UH36 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SRRDQ9UH36 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SRRDQ9UH36 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SRRDQ9UH36 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SRRDQ9UH36 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SRRDQ9UH36 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SRRDQ9UH36 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SRRDQ9UH36 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SRRDQ9UH36 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SRRDQ9UH36 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SRRDQ9UH36 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SRRDQ9UH36 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SRRDQ9UH36 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SRRDQ9UH36 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SRRDQ9UH36 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SRRDQ9UH36 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SRRDQ9UH36 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SRRDQ9UH36 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SRRDQ9UH36 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SRRDQ9UH36 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SRRDQ9UH36 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SRRDQ9UH36 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
SRRDQ9UH36 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SRRDQ9UH36 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SRRDQ9UH36 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SRRDQ9UH36 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SRRDQ9UH36 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SRRDQ9UH36 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SRRDQ9UH36 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SRRDQ9UH36 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SRRDQ9UH36 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SRRDQ9UH36 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SRRDQ9UH36 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
SRRDQ9UH36 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
SRRDQ9UH36 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SRRDQ9UH36 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SRRDQ9UH36 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SRRDQ9UH36 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SRRDQ9UH36 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SRRDQ9UH36 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
SRRDQ9UH36 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SRRDQ9UH36 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SRRDQ9UH36 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SRRDQ9UH36 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SRRDQ9UH36 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SRRDQ9UH36 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SRRDQ9UH36 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SRRDQ9UH36 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SRRDQ9UH36 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SRRDQ9UH36 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SRRDQ9UH36 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SRRDQ9UH36 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SRRDQ9UH36 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SRRDQ9UH36 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SRRDQ9UH36 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SRRDQ9UH36 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SRRDQ9UH36 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SRRDQ9UH36 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SRRDQ9UH36 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SRRDQ9UH36 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SRRDQ9UH36 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SRRDQ9UH36 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SRRDQ9UH36 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SRRDQ9UH36 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SRRDQ9UH36 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SRRDQ9UH36 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SRRDQ9UH36 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SRRDQ9UH36 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SRRDQ9UH36 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SRRDQ9UH36 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SRRDQ9UH36 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SRRDQ9UH36 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SRRDQ9UH36 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SRRDQ9UH36 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SRRDQ9UH36 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SRRDQ9UH36 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SRRDQ9UH36 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SRRDQ9UH36 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SRRDQ9UH36 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SRRDQ9UH36 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SRRDQ9UH36 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SRRDQ9UH36 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SRRDQ9UH36 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SRRDQ9UH36 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SRRDQ9UH36 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SRRDQ9UH36 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SRRDQ9UH36 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SRRDQ9UH36 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SRRDQ9UH36 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SRRDQ9UH36 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SRRDQ9UH36 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SRRDQ9UH36 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SRRDQ9UH36 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms