Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2S2

NRXN2, Neurexin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN2Q9P2S2 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
NRXN2Q9P2S2 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NRXN2Q9P2S2 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NRXN2Q9P2S2 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NRXN2Q9P2S2 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
NRXN2Q9P2S2 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NRXN2Q9P2S2 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
NRXN2Q9P2S2 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
NRXN2Q9P2S2 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
NRXN2Q9P2S2 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
NRXN2Q9P2S2 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
NRXN2Q9P2S2 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
NRXN2Q9P2S2 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NRXN2Q9P2S2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NRXN2Q9P2S2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NRXN2Q9P2S2 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NRXN2Q9P2S2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NRXN2Q9P2S2 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NRXN2Q9P2S2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NRXN2Q9P2S2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NRXN2Q9P2S2 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NRXN2Q9P2S2 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NRXN2Q9P2S2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NRXN2Q9P2S2 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NRXN2Q9P2S2 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NRXN2Q9P2S2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NRXN2Q9P2S2 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NRXN2Q9P2S2 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NRXN2Q9P2S2 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
NRXN2Q9P2S2 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NRXN2Q9P2S2 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NRXN2Q9P2S2 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NRXN2Q9P2S2 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NRXN2Q9P2S2 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NRXN2Q9P2S2 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NRXN2Q9P2S2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NRXN2Q9P2S2 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
NRXN2Q9P2S2 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
NRXN2Q9P2S2 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.19
NRXN2Q9P2S2 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
NRXN2Q9P2S2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
NRXN2Q9P2S2 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
NRXN2Q9P2S2 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
NRXN2Q9P2S2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NRXN2Q9P2S2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NRXN2Q9P2S2 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NRXN2Q9P2S2 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NRXN2Q9P2S2 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NRXN2Q9P2S2 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NRXN2Q9P2S2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NRXN2Q9P2S2 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
NRXN2Q9P2S2 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NRXN2Q9P2S2 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NRXN2Q9P2S2 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NRXN2Q9P2S2 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NRXN2Q9P2S2 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NRXN2Q9P2S2 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NRXN2Q9P2S2 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NRXN2Q9P2S2 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
NRXN2Q9P2S2 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NRXN2Q9P2S2 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NRXN2Q9P2S2 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NRXN2Q9P2S2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NRXN2Q9P2S2 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NRXN2Q9P2S2 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NRXN2Q9P2S2 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NRXN2Q9P2S2 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NRXN2Q9P2S2 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
NRXN2Q9P2S2 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NRXN2Q9P2S2 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NRXN2Q9P2S2 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NRXN2Q9P2S2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NRXN2Q9P2S2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NRXN2Q9P2S2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NRXN2Q9P2S2 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NRXN2Q9P2S2 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
NRXN2Q9P2S2 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NRXN2Q9P2S2 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NRXN2Q9P2S2 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NRXN2Q9P2S2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NRXN2Q9P2S2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NRXN2Q9P2S2 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NRXN2Q9P2S2 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NRXN2Q9P2S2 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NRXN2Q9P2S2 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NRXN2Q9P2S2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NRXN2Q9P2S2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NRXN2Q9P2S2 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NRXN2Q9P2S2 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
NRXN2Q9P2S2 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
NRXN2Q9P2S2 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
NRXN2Q9P2S2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NRXN2Q9P2S2 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NRXN2Q9P2S2 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NRXN2Q9P2S2 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NRXN2Q9P2S2 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NRXN2Q9P2S2 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NRXN2Q9P2S2 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NRXN2Q9P2S2 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NRXN2Q9P2S2 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms