Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZJ4

SACS, Sacsin, humanhuman

Predictions only

Length 4,579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SACSQ9NZJ4 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SACSQ9NZJ4 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SACSQ9NZJ4 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SACSQ9NZJ4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SACSQ9NZJ4 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SACSQ9NZJ4 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SACSQ9NZJ4 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SACSQ9NZJ4 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SACSQ9NZJ4 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SACSQ9NZJ4 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SACSQ9NZJ4 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SACSQ9NZJ4 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SACSQ9NZJ4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SACSQ9NZJ4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SACSQ9NZJ4 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SACSQ9NZJ4 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SACSQ9NZJ4 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
SACSQ9NZJ4 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SACSQ9NZJ4 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
SACSQ9NZJ4 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SACSQ9NZJ4 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SACSQ9NZJ4 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SACSQ9NZJ4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SACSQ9NZJ4 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SACSQ9NZJ4 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SACSQ9NZJ4 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SACSQ9NZJ4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SACSQ9NZJ4 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SACSQ9NZJ4 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SACSQ9NZJ4 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SACSQ9NZJ4 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SACSQ9NZJ4 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SACSQ9NZJ4 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SACSQ9NZJ4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SACSQ9NZJ4 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SACSQ9NZJ4 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SACSQ9NZJ4 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SACSQ9NZJ4 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SACSQ9NZJ4 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SACSQ9NZJ4 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SACSQ9NZJ4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SACSQ9NZJ4 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SACSQ9NZJ4 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SACSQ9NZJ4 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SACSQ9NZJ4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SACSQ9NZJ4 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SACSQ9NZJ4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SACSQ9NZJ4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SACSQ9NZJ4 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SACSQ9NZJ4 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SACSQ9NZJ4 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SACSQ9NZJ4 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SACSQ9NZJ4 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SACSQ9NZJ4 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SACSQ9NZJ4 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SACSQ9NZJ4 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SACSQ9NZJ4 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SACSQ9NZJ4 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SACSQ9NZJ4 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SACSQ9NZJ4 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SACSQ9NZJ4 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SACSQ9NZJ4 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SACSQ9NZJ4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SACSQ9NZJ4 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SACSQ9NZJ4 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SACSQ9NZJ4 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SACSQ9NZJ4 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SACSQ9NZJ4 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SACSQ9NZJ4 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SACSQ9NZJ4 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SACSQ9NZJ4 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SACSQ9NZJ4 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SACSQ9NZJ4 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SACSQ9NZJ4 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SACSQ9NZJ4 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SACSQ9NZJ4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SACSQ9NZJ4 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SACSQ9NZJ4 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SACSQ9NZJ4 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SACSQ9NZJ4 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SACSQ9NZJ4 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SACSQ9NZJ4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SACSQ9NZJ4 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SACSQ9NZJ4 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SACSQ9NZJ4 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SACSQ9NZJ4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SACSQ9NZJ4 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SACSQ9NZJ4 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SACSQ9NZJ4 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SACSQ9NZJ4 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SACSQ9NZJ4 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SACSQ9NZJ4 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SACSQ9NZJ4 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SACSQ9NZJ4 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SACSQ9NZJ4 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SACSQ9NZJ4 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SACSQ9NZJ4 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SACSQ9NZJ4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SACSQ9NZJ4 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SACSQ9NZJ4 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms